分子动力学模拟
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如何计算离子迁移扩散?
本文华算科技系统介绍了离子迁移扩散在多个科学领域中的重要性,特别是在分子动力学模拟中的核心作用。相关往期文章:均方位移(MSD)如何计算扩散系数? 通过均方位移(MSD)分析,读者…
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什么是固体电解质界面膜(SEI膜)?
说明:本文华算科技系统介绍了固体电解质界面膜(SEI膜)的基本定义、形成过程及其相关计算化学研究。 通过理论计算(DFT、AIMD/MD与多尺度建模)可以揭示分解路径、产物性质与成…
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均方位移(MSD)如何计算扩散系数?
本文华算科技系统介绍了均方位移(MSD)在分子动力学模拟中的核心作用及其与扩散行为的关联,读者可深入理解如何通过MSD分析粒子运动、计算扩散系数,并将其与宏观性能如电导率、渗透性等…
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什么是共价有机框架?定义、功能及计算化学研究全解析
说明:本文华算科技系统介绍了共价有机框架(COF)的基本定义、主要功能及其相关计算化学研究。在计算化学方面,可用DFT解析电子结构与吸附位点,用GCMC预测等温线与选择性,用MD描…
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如何进行外磁场下的分子动力学模拟
说明:随着纳米技术与材料科学的飞速发展,理解和调控物质在外部磁场下的行为变得至关重要。外磁场下的分子动力学(Molecular Dynamics, MD)模拟,作为一种连接微观机理…
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势函数:分子动力学模拟中的关键要素与选择指南
说明:本文华算科技介绍了势函数的重要性、类型差异以及根据体系和目标选择如何选择合适的势函数。分子动力学模拟中的势函数至关重要,本文华算科技系统介绍了势函数的类型,包括经典非反应力场…
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聚合物模拟:从计算化学视角解析软件选择与建模策略
说明: 本文华算科技从计算化学角度概述什么软件能模拟聚合物,同时说明了聚合物的结构特征与“弹簧—球”模型,介绍采样与尺度问题及分层建模策略(DFT、MD及机器学习等)。 举例说明了…
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什么是径向分布函数(RDF)?电解液微观结构与性能分析的核心
说明:径向分布函数RDF是研究电解液微观结构与电化学性能关系的重要工具。其定义反映参考粒子周围其他粒子出现的相对概率,可用于揭示电解液中离子、溶剂等的微观结构。通过分析RDF,可理…
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什么是ReaxFF反应力场?从原子尺度模拟到计算化学的关键方法
说明:ReaxFF(反应力场)作为一种创新的分子模拟方法,通过引入动态键序概念,实现了对化学键断裂与形成的原子尺度模拟,显著拓展了分子动力学在反应过程研究中的应用范围。 本文华算科…
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什么是MOF?定义、优势、应用及计算化学研究
说明: MOF是由金属节点与有机配体通过配位键连接而成的多孔晶体材料,具有超高比表面积、可调控孔径和化学多样性,被广泛用于气体吸附、储能、催化等领域。 本文系统解析了MOF材料的定…
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什么是离子液体?结构、性能与多尺度研究方法
说明:离子液体是由阴、阳离子在室温或近室温条件下构成的液态盐。由于缺乏传统溶剂的屏蔽作用,其内部存在强烈的静电相互作用和显著的离子–离子关联效应。 为深入理解此类结构&…
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【第三期】怎样算多种组分体系的两两相互作用能? | MS Forcite 相互作用能计算 分子动力学
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:如何计算多组分体系中两种组分(如水分子与EG分子)的相互作用能,通过定义layer1、layer2及排除其他组分(layer3)…
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【第二期】怎样在结构中反选原子?| MS Forcite 相互作用能计算 分子动力学
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:如何在MS Forcite中反选原子,通过Edit Sets功能选中水分子和EG分子后,利用“Select by Propert…
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均方位移(MSD):在分子动力学模拟中的意义与应用
说明:本文华算科技重点介绍了均方位移(MSD)在分子动力学模拟中的应用与意义,并结合GROMACS进行了直观说明。 什么是MSD? 均方位移(mean squared displa…
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自组装分子动力学模拟:原理、流程、应用与挑战
说明:本文华算科技系统介绍了自组装分子动力学模拟的原理、标准流程(构建–最小化–平衡–生产–分析)、关键应用(如软物质与生物大分子组…
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DFT计算,分子动力学计算怎么设置才节省硬盘空间?| Materials Studio Forcite CASTEP DMol3 | 华算科技 MS杨站长
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:在使用 Materials Studio 软件的 Forcite、CASTEP、DMol3 等模块进行 DFT 计算和分子动力学…
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异质界面限域:多维度约束下的协同调控机制与性能优化
界面限域(Interfacial Confinement)作为近年来材料科学、物理化学与能源研究中的关键概念,逐渐发展成为解释和调控物质性能的重要理论框架。 所谓界面限域,是指在两…
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径向分布函数(RDF)在材料模拟与结构表征中的核心应用与解析方法
径向分布函数(Radial Distribution Function,简称RDF)是物理学和化学中一个非常重要的概念,特别是在描述液体、气体及固体的结构时,广泛应用于分子动力…
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DFT自洽计算(SCF)核心解析:Kohn-Sham方程迭代流程与收敛原理
密度泛函理论(Density Functional Theory,DFT)是现代计算物理和材料科学中一种重要的理论方法,用于研究多电子体系的电子结构和性质。 在DFT计算中,自洽计…
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氢键统计揭示分子奥秘:蛋白质折叠稳定性与药物结合能的动态网络分析
氢键统计是分子动力学模拟中用于分析分子间或分子内相互作用的重要工具,它能够提供关于氢键形成、断裂、分布以及其对系统结构和性质影响的详细信息。 通过氢键统计,研究人员可以深入了解水分…