VASP软件及计算方法
-
晶界模型如何用于催化?
晶界不是普通台阶位的另一个名字。台阶位通常出现在同一晶面上的高度突变,而晶界来自两个晶粒取向拼接后的边界区域。边界附近会出现低配位原子、拉伸或压缩应变、空位富集、杂原子偏聚和局域电…
-
硫空位怎么建模?
引言 硫空位常见于 MoS2、WS2、CoSx 和金属硫化物表面。很多模型看起来只是少了一个 S,但它们回答的问题并不一样:面内空位看基面如何被激活,边缘空位看低配位边界如何成键,…
-
如何处理缺陷电荷态?
引言 缺陷电荷态是 VASP 里很容易混淆的一类问题。很多人看到 q = +1 或 q = −1,就以为是在给某个原子手动指定价态;实际不是。带电缺陷计算改变的是整个超胞的电子数,…
-
VASP收敛参数辨析:EDIFF 与 EDIFFG 物理对象、收敛条件及阈值适配规则
说明:本文华算科技主要介绍 VASP中 EDIFF 与 EDIFFG 的计算对象、停止条件、正负号含义,以及它们在静态计算、结构优化和声子计算中的阈值匹配。 VASP 两类收敛标准…
-
VASP脚本使用手册 | 电荷密度计算脚本获取原子局域电荷数值、CHGCAR文件格式转换至CUBE格式
本期脚华算科技朱老师介绍如何处理VASP计算得到的CHGCAR电荷文件,因此计算前需确认是否设置了LCHARG = .TRUE.。以Si单质自洽计算得到的CHGCAR为例。注:该例…
-
VASP脚本使用手册 | 电荷密度计算脚本之获取自旋电荷密度及平均投影电荷密度
本期脚本介绍如何处理VASP计算得到的CHGCAR/PARCHG电荷文件,因此计算前需确认是否设置了LCHARG = .TRUE.及LPARD = .TRUE.等参数。以Si单质自…
-
VASP脚本使用手册 | 输出优化过程中原子运动轨迹及速度
本期的脚本华算科技朱老师介绍的是输出优化过程中原子运动轨迹及速度,以MgO为例,结构如下: 脚本013:xdat2xyz.pl 介绍:将XDATCAR输出为xyz轨迹文件 用法:输…
-
VASP脚本使用手册 | NEB计算脚本系列之获取收敛信息、修改原子坐标
本期华算科技介绍NEB计算脚本系列之如何获取收敛信息、修改原子坐标。 本期的脚本为过渡态计算中需要用到的脚本,下面以单层石墨烯上Pt扩散为例进行介绍: 扩散方向如下图所示,1号位点…
-
VASP脚本使用手册 | 不同格式结构文件转换
本期脚本介绍的是不同格式结构文件如何转换,以MgO为例,结构如下: POSCAR文件内容如下: 脚本011:pos2con.pl 介绍:把POSCAR转换成con格式文件 用法:输…
-
VASP脚本使用手册 | POSCAR处理之等比缩放晶胞、获取中间态结构、输出径向分布
这次我们分享的是POSCAR处理之等比缩放晶胞、获取中间态结构、输出径向分布这些功能的脚本的使用方法。 脚本004:boxset.pl 介绍:修改POSCAR中的晶格系数 用法:输…
-
VASP脚本使用手册 | NEB计算脚本系列之绘制势垒拟合线、导出轨迹图
本期介绍的是NEB计算脚本系列之绘制势垒拟合线、导出轨迹图,本期的脚本为过渡态计算中需要用到的脚本, 下面以单层石墨烯上Pt扩散为例进行介绍:扩散方向如下图所示,1号位点为起始位点…
-
VASP脚本使用手册 | POSCAR处理之对比POSCAR文件的差异
这次我们分享的是POSCAR处理之对比POSCAR文件的差异的脚本使用方法。 脚本领取方式:长按下方二维码,回复关键词“脚本” 本期的脚本操作以Pt吸附在CeO2(111)面为例。…
-
VASP脚本使用手册 | NEB计算脚本系列之生成中间态结构、读取极值点能量及受力
本次分享的是一套与过渡态、电荷密度、态密度等性质相关的脚本包VTST (Transition State Tools for VASP),我们将持续更新脚本使用教程。 具体功能包括…
-
VASP脚本使用手册 | 获取力和能量收敛趋势、一键续算功能
本次分享的是一套与过渡态、电荷密度、态密度等性质相关的脚本包VTST (Transition State Tools for VASP)。 具体功能包括过渡态计算的初始路线设置和能…
-
VESTA官方手册 | 第十六章:首选项
第十六章 首选项 VESTA中的默认设置可以在Preferences对话框中更改(图16.1)。 图16.1:Preferences对话框 16.1 RIETAN的设置 用于模拟X…
-
VESTA官方手册 | 第十七章:输入和输出文件
第十七章:输入和输出文件 17.1 体数据的文件格式 体数据由三维空间中的规则网格组成。每个栅格点的体积元素“体元”表示栅格点上的值。体元类似于像素,它表示2D图像数据。 通常,有…
-
VESTA官方手册 | 附录A:键盘快捷键
表A.1:键盘快捷键 全局(菜单) Ctrl + N File菜单-New Structure… Ctrl + O File菜单-Open… Ctrl + …
-
VESTA官方手册 | 第十四章:工具面板
往期推荐 VESTA官方手册 | 第一章:绪论和背景 VESTA官方手册 | 第二章:软件功能概述 VESTA官方手册 | 第三章:准备与开始 VESTA官方手册 | 第四章:…
-
VESTA官方手册 | 第十一章:交互式操作
往期推荐 VESTA官方手册 | 第一章:绪论和背景 VESTA官方手册 | 第二章:软件功能概述 VESTA官方手册 | 第三章:准备与开始 VESTA官方手册 | 第四章:…
-
VESTA官方手册 | 第十三章:整体外观
往期推荐 VESTA官方手册 | 第一章:绪论和背景 VESTA官方手册 | 第二章:软件功能概述 VESTA官方手册 | 第三章:准备与开始 VESTA官方手册 | 第四章:…