VASP软件及计算方法

  目的：介绍利用Adsorption Locator模块研究不同类型吸附质在不同性质衬底上吸附的计算方法。 所用模块：Materials Visualizer、Adsorptio…

  目的：说明如何使用Adsorption Locator模块计算结合能以评估添加剂的应用潜力。 所用模块：Materials Visualizer, Adsorption Loc…

  目的：演示如何使用Amorphous Cell模块将分子填充到现有结构中 所用模块：Materials Visualizer, Amorphous Cell 先决条件：使用po…

目的：演示如何使用Blends模块筛选分子相互作用。 所用模块：Materials Visualizer、Blends、Forcite（可选） 前提条件：polymer build…

  目的：介绍如何使用Cantera Reaction Editor创建或修改反应机制。 所用模块：Materials Visualizer、Cantera、DMol3 前提条件：…

目的：介绍使用DMol3和反应预览Reaction Preview工具执行过渡状态搜索计算的方法。计算并验证了简单反应的过渡态。 所用模块：Materials Visualizer…

目的：介绍了DMol3预测分子体系热力学性质的方法。 所用模块：Materials Visualizer、DMol3 前提条件：利用DMol3中的离域内坐标对固体进行几何优化（Ge…

目的：介绍在Materials Studio中使用DMol3进行最小能量路径计算的方法。 所用模块：Materials Visualizer、DMol3 前提条件：利用LST/QS…

目的：介绍利用DMol3计算光学性质的方法。 所用模块：Materials Visualizer、DMol3 前提条件：绘制简单分子结构可视化工具（Sketching simple…

目的：介绍周期体系的离域内部坐标优化方法和体积可视化工具的使用。 所用模块：Materials Visualizer、DMol3 前提条件：等值面和切片可视化工具使用（Workin…

本期脚华算科技朱老师介绍如何处理VASP计算得到的CHGCAR电荷文件，因此计算前需确认是否设置了LCHARG = .TRUE.。以Si单质自洽计算得到的CHGCAR为例。注：该例…

本期脚本介绍如何处理VASP计算得到的CHGCAR/PARCHG电荷文件，因此计算前需确认是否设置了LCHARG = .TRUE.及LPARD = .TRUE.等参数。以Si单质自…

本期的脚本华算科技朱老师介绍的是输出优化过程中原子运动轨迹及速度，以MgO为例，结构如下： 脚本013：xdat2xyz.pl 介绍：将XDATCAR输出为xyz轨迹文件 用法：输…

本期华算科技介绍NEB计算脚本系列之如何获取收敛信息、修改原子坐标。 本期的脚本为过渡态计算中需要用到的脚本，下面以单层石墨烯上Pt扩散为例进行介绍： 扩散方向如下图所示，1号位点…

本期脚本介绍的是不同格式结构文件如何转换，以MgO为例，结构如下： POSCAR文件内容如下： 脚本011：pos2con.pl 介绍：把POSCAR转换成con格式文件 用法：输…

这次我们分享的是POSCAR处理之等比缩放晶胞、获取中间态结构、输出径向分布这些功能的脚本的使用方法。 脚本004：boxset.pl 介绍：修改POSCAR中的晶格系数 用法：输…

本期介绍的是NEB计算脚本系列之绘制势垒拟合线、导出轨迹图，本期的脚本为过渡态计算中需要用到的脚本， 下面以单层石墨烯上Pt扩散为例进行介绍：扩散方向如下图所示，1号位点为起始位点…

这次我们分享的是POSCAR处理之对比POSCAR文件的差异的脚本使用方法。 脚本领取方式：长按下方二维码，回复关键词“脚本” 本期的脚本操作以Pt吸附在CeO2（111）面为例。…

本次分享的是一套与过渡态、电荷密度、态密度等性质相关的脚本包VTST (Transition State Tools for VASP)，我们将持续更新脚本使用教程。 具体功能包括…

本次分享的是一套与过渡态、电荷密度、态密度等性质相关的脚本包VTST (Transition State Tools for VASP)。 具体功能包括过渡态计算的初始路线设置和能…