
本期的脚本操作以Pt吸附在CeO2(111)面为例。两个POSCAR除了Pt坐标不一样,CeO2各原子坐标相同。
介绍:比较两个POSCAR中原子坐标,晶格基矢的差异
用法:输入diffcon.pl POSCAR1 POSCAR2。工作窗口直接打印出对比信息。
当前工作窗口输入命令(确认当前目录下有两个POSCAR文件)。
工作窗口直接打印出原子坐标,晶格基矢的差异。由于POSCAR1与POSCAR2中只有Pt原子的坐标不一样,故其他原子的坐标差异为0。
介绍:计算两个POSCAR中原子坐标差异的平方根距离
用法:输入dist.pl POSCAR1 POSCAR2。工作窗口直接打印计算结果
输入命令后直接输出原子坐标差异的平方根距离。该数据为Pt原子坐标差异的平方根。
用法:输入modemake.pl POSCAR1 POSCAR2。
使用cat命令查看输出内容。由于其他原子坐标相同,因此只显示Pt原子坐标差异的单位向量。
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