这次我们分享的是POSCAR处理之等比缩放晶胞、获取中间态结构、输出径向分布这些功能的脚本的使用方法。
用法:输入boxset.pl POSCAR (lattice constant),得到POSCAR.out文件
介绍:根据两个POSCAR文件(相同原子及个数、相同晶胞、不同原子坐标)中原子坐标的不同构建中间态的POSCAR文件
用法:输入posinterp.pl POSCAR1 POSCAR2 (fraction),得到POSCAR.out文件。fraction的数值定义从POSCAR1到POSCAR2的原子变动的百分比。当fraction=1时,POSCAR.out中的原子坐标与POSCAR2相同
介绍:获取POSCAR中指定原子与其它原子距离的径向分布
用法:输入pos2rdf.pl (POSCAR) (atom) (bin size),直接打印给定区间(bin size)的径向分布
用法:neighbors.pl (con file) (atom),得到neighdist.dat
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这是一套与过渡态、电荷密度、态密度等性质相关的脚本包VTST (Transition State Tools for VASP)。
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