VASP入门手册 | 第四章:化学键设置

 

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往期文章:

VASP入门手册 | 第一章:CIF文件查找与下载,Materials Project数据库的使用!

VASP入门手册 | 第二章:POSCAR文件生成

VASP入门手册 | 第三章:图片文件生成

VESTA中设置化学键,需要选择哪些原子间成键以及化学键的距离,同时需要注意VESTA中设置的化学键仅仅是一个球棍模型,并不反映原子之间实际的相互作用。
第一步:File-open打开Si的CIF文件
VASP入门手册 | 第四章:化学键设置
第二步:Edit-Bonds,弹出一个弹出框
VASP入门手册 | 第四章:化学键设置
第三步:在上一步弹出框中出现很多选择项,依次解释如下:
A1
需要成键的原子1和原子2,位置可互换
A2
New
新建成键模式,可设置多个化学键
Search A2 bonded to A1
以A1原子为中心,A2与A1成键
Search atoms bonded to A1
以A1原子为中心,任何原子与A1成键
Search molecules
搜索分子
化学键搜索范围
距离在min-max范围内的A1和A2原子会连上一根化学键
Min.length
最小值
Max.length
最大值
Boundary mode边界模式
成键原子筛选模式
Do not search atoms beyond the boundary
所有原子均在晶胞内
Search additional atoms if A1 is included in the boundary
A1原子在晶胞内,A2原子可以不在晶胞内
Search additional atoms recursively if either A1 or A2 is visible
A1与A2间递归的相互搜索
根据上面的介绍,以Si为例,我们选择如下:
VASP入门手册 | 第四章:化学键设置
第四步,点击OK。可看到化学键已经设置好
VASP入门手册 | 第四章:化学键设置

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