分子动力学

说明：本文主要介绍微观动力学所需的 DFT 结构、能量、振动频率与环境数据，以及这些数据怎样用于计算速率常数、表面覆盖度和产物生成速率。 微观动力学的反应网络与速率方程 微观动力学…

说明：本文华算科技主要介绍径向分布函数的统计定义、近邻数量与元素配对含义，以及 RDF 对三维结构、原子运动和实验散射的描述范围。 RDF定义为何含球壳体积数密度？ 在液体中，以一…

每次跑MD模拟都被各种算法和系综搞晕？不知道Verlet算法、蛙跳（Leap-frog）算法和预测-校正格式到底怎么选？ 华算科技这里有一份超硬核的学习资料“分子动力学模拟方法”，…

说明：本文华算科技主要介绍聚合物模拟中链模型的构造、力场参数的来源、构象与缠结的统计量，以及原子模型向粗粒化和介观模型转换时保留的物理信息。 聚合物模型的基本构成？ 聚合物的化学式…

说明：本文华算科技主要介绍 AIMD 与经典 MD 的受力来源、配位与成键描述、电子和原子核近似，以及模拟时长对材料计算的影响。 AIMD经典MD定义与受力来源？ 给定液态水中全部…

说明：本文华算科技主要介绍均方位移（MSD）的统计定义、时间标度、方向与集体分解，以及有限轨迹中的坐标和误差来源。 MSD 是什么，怎样由轨迹构造？ 分子动力学轨迹记录原子或分子在…

说明：本文华算科技主要介绍分子动力学模拟中的微观状态、离散时间推进、轨迹统计、时间相关函数，以及模型、时长和体系尺寸对计算结论的限制。 基本概念：微观状态怎样随时间推进？ 分子动力…

说明：本文华算科技主要介绍界面水分子取向的矢量定义、概率分布、空间条件化、转动相关函数，以及表面状态和光谱信号对取向归属的约束。 界面水分子取向的基本定义是什么？ 对轨迹中每个完整…

说明：本文华算科技主要介绍密度泛函理论、分子动力学和蒙特卡洛方法在材料计算中的描述对象、迭代方式、可观测量与适用问题。 DFT、MD 和 MC 经常出现在同一项材料研究中，却分属不…

看不懂牛顿运动方程的积分算法？搞不清分子动力学？ 这65页【分子动力学方法与计算机模拟及计算模拟举例（MD）PPT】全面梳理了： 核心理论：从L-J势、EAM势的选择，到Verle…

做材料设计和物理化学计算，怎么能不懂分子动力学？今天华算科技分享一份超详细的65页PPT《分子动力学方法与计算机模拟》！ ✅透彻讲解MD的五个核心要素：粒子间相互作用势、初始条件、…

说明：本文华算科技主要介绍分子动力学模拟的计算对象、力场来源、轨迹生成、常见统计量和适用条件。 分子动力学模拟的计算对象是什么 分子动力学模拟把材料写成一组随时间移动的粒子。粒子可…

说明：径向分布函数（Radial Distribution Function, RDF）是描述粒子或电子在空间中分布情况的重要物理量，广泛应用于原子物理、材料科学、化学、生物物理等…

福井函数（Fukui Function）是化学反应性理论中的一个重要概念，它由日本化学家福井谦一（Kenichi Fukui）于1952年提出，并在1981年与莱纳斯·鲍林（Lin…

均方位移（Mean Square Displacement, MSD）是物理学、化学、材料科学和生物学等多个领域中用于描述粒子或分子在空间中运动特性的基本参数。它通过统计分析粒子在…

径向分布函数（Radial Distribution Function, RDF）是描述粒子或电子在空间中分布情况的重要物理量，广泛应用于原子物理、材料科学、化学、生物物理等领域。…

说明：本文华算科技介绍了从头算分子动力学（AIMD）与经典分子动力学（MD）的主要区别。 AIMD通过实时量子力学计算电子结构，精度高但计算量大；MD依赖经验力场，效率高但无法描述…

说明：本文华算科技系统介绍了粗粒化分子动力学（CGMD）的基本概念、主要方法及其在生物、材料和药物领域的应用。通过学习本文，读者能够了解CGMD在多尺度模拟中的重要作用，掌握Mar…

说明：本文华算科技介绍了通过分子动力学（MD）和多尺度模拟方法计算材料应力–应变曲线的理论策略，系统阐述了从原子尺度模拟力学行为的科学方法。 读者可学习到如何利用MD模…

说明：本文华算科技系统介绍了福井函数的基本定义、计算方法与实际应用，重点阐述了其作为概念密度泛函理论核心描述符，通过电子密度对电子数的偏导数来量化分子反应活性的原理，以及三种函数形…