分子动力学
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什么是自组装分子动力学模拟?
自组装分子动力学模拟是一种利用分子动力学方法研究分子在无外力作用下通过非共价相互作用（如范德华力、氢键等）自发组织成有序结构的模拟技术。它广泛应用于研究纳米材料、生物分子、聚合物等…
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膜材料模拟中的分子动力学手段：扩散轨迹、径向分布函数及传输特性分析
膜分离技术在水处理、气体分离和能源回收等领域具有重要应用，常见的膜材料包括石墨烯、金属有机框架（MOF）、共价有机框架（COF）和聚合物膜。 分子动力学模拟为研究膜材料的分子层次特…
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为何选择MD？分子动力学模拟在电解液研究中的应用
基本原理与核心概念 分子动力学（MD）模拟基于牛顿运动方程，通过追踪每个原子的轨迹来揭示体系的动态行为。其核心在于ergodic定理的适用性，即体系的时间平均与系综平均等价[7]。…
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分子力学（MD）与密度泛函理论（DFT）的核心区别与应用
分子动力学模拟（MD）和密度泛函理论（DFT）是计算化学领域常用的两种重要工具，广泛应用于物质的结构、性质以及反应机制的研究。 尽管它们在模拟对象上有很多交集，但它们在原理和应用上…
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如何模拟离子扩散？均方位移（MSD）理论与跨尺度应用解析！
均方位移（MSD）是分子动力学模拟中表征粒子扩散行为的关键指标。本文系统介绍了MSD的理论基础、计算方法和特征规律，重点展示了其在电池（离子迁移）、催化（质子扩散）、合金（高温变形…
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机器学习势函数 VS 分子动力学（MD）模拟
机器学习势函数的定义与基本原理 机器学习势函数（Machine Learning Potentials, MLFFs）是一种基于机器学习技术的势能函数，用于模拟分子和材料的物理行为…
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分子动力学模拟：原理、步骤、软件、方法！
在微观世界中，分子的动态行为如同一场精妙的舞蹈，深刻影响着物质的性质和功能。分子动力学模拟（Molecular Dynamics, MD）作为探索分子尺度奥秘的强大工具，是一种基于…
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DFT计算还是MD模拟？——两种主流计算方法的正确应用方式
本文系统比较了第一性原理计算（以密度泛函理论为代表）与分子动力学模拟在材料研究中的理论基础、应用特征与适用边界。 第一性原理计算以电子结构为核心，擅长于吸附行为、反应路径与过渡态分…
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如何通过RDF分析材料结构？
本文系统介绍了径向分布函数（RDF）的定义、数学表达及其在分子动力学（MD）模拟中的核心作用。 RDF通过量化粒子间距的概率分布，能够揭示材料短程有序性和长程无序性特征，成为解析微…
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分子动力学模拟（Molecular Dynamics, MD）
分子动力学模拟（Molecular Dynamics, MD）是一种通过经典力学方法研究原子和分子随时间演化行为的计算模拟技术。 其基本思想是根据牛顿第二定律，利用原子间相互作用的…
