说明:本文华算科技阐释了氢键的核心定义、多维度分类、量化公式。读者通过本文可掌握氢键的形成本质,了解常规/非常规、强/中/弱等不同类型氢键的特征与典型示例,学会利用键长、键角、红外红移量等参数量化氢键强度。


氢键的经典定义可以表示为X-H······Y,氢供体(X-H)与氢受体(Y)之间形成的定向相互作用。其中X为电负性强、半径小的原子,通常为N、O、F,部分情况下可扩展至Cl、S等;Y为含孤对电子的电负性原子,同样以N、O、F为主。

其本质是:X的高电负性使H原子呈现部分正电荷(δ⁺),近乎一个“裸露”的质子,与Y的孤对电子形成静电吸引,同时伴随一定程度的轨道重叠,最终形成定向、有饱和性与方向性的弱相互作用。
氢键的能量介于弱范德华力≈0.5kJmol-1和共价键≈300kJmol-1之间,常在5–30kJmol-1之间。正因为它既不易被肉眼看到,又能显著提升分子间的黏合强度,常被形象地称为“隐形胶水”。



按氢供体与受体的原子类型分类
氢键的形成依赖电负性强、半径小的X,与Y含孤对电子的原子特性,核心类型及特征如下:
(1)常规氢键:
X、Y为N/O/F,这类氢键强度较强,键能介于20~40 kJ/mol,兼具显著静电作用与共价成分,是调控物质结构、性能的关键作用力。
O-H…O氢键:最常见类型,存在于水、醇、羧酸、聚合物等体系中。如水分子间H2O…H-O-H、乙醇与水的混合溶液、羧酸二聚体R-COOH…O=C-R、聚合物中羟基-OH与羰基C=O的相互作用。键能10~30 kJ/mol,键角接近180 °,是维持液态水、生物膜结构的关键。

O-H…N氢键:广泛存在于生物分子、超分子材料中。如蛋白质中肽键的-OH与氨基-NH2、DNA碱基对,如腺嘌呤的-NH2与胸腺嘧啶的C=O、MOF材料中配体的-OH与氨基的相互作用。键能8~25 kJ/mol,方向性较强,对生物大分子构象稳定至关重要。

N-H…O氢键:与O-H…N氢键互补,常见于酰胺、胺类化合物。如尼龙分子链间的酰胺键-NH-CO-…O=C-NH-、酶活性位点的-NH2与底物的C=O键能7~20 kJ/mol,是聚合物力学强度提升、酶-底物特异性结合的核心作用力。

N-H…N氢键:多见于含氮杂环、胺类体系。如咪唑分子间、DNA中鸟嘌呤与胞嘧啶的碱基对3个N-H…N氢键、超分子凝胶中脲基-NH-CO-NH-的相互作用。键能5~15 kJ/mol,虽强度较弱,但数量累积可显著提升体系稳定性。

F-H…F氢键:最强的常规氢键,仅存在于含F-H的化合物中。如HF二聚体F-H…F-H、氟代醇与氟离子的相互作用。键能20~40 kJ/mol,键长极短r(H…F)≈1.5~2.0Å,含显著共价成分。

(2)非常规氢键
X为C/S/P等,Y为N/O/S等,这类氢键强度较弱,键能1~10 kJ/mol,但在分子识别、晶体堆积中起重要作用,且数量常占优势。
C-H…O氢键:最常见的非常规氢键,C原子需与电负性基团,如C=O、CN相连,使C-H键极化,H呈部分正电荷。
如苯环上的C-H与羰基C=O、蛋白质中疏水侧链的C-H与肽键的O、超分子组装体中的芳香环C-H…O相互作用。键能3~8 kJ/mol,键角范围宽100 °~160 °,是晶体堆积、分子自组装的辅助作用力。
C-H…N氢键:多见于芳香杂环、腈类化合物。如吡啶环的C-H与咪唑的N、腈类化合物R-CN与芳香环的相互作用。键能2~7 kJ/mol,在药物分子与靶点蛋白的结合中起协同作用。
S-H…O/N氢键:存在于硫醇、硫酚类化合物中。如半胱氨酸的-SH与酪氨酸的-OH、硫酚与胺类的相互作用。键能4~12 kJ/mol,在蛋白质二硫键还原、催化反应中起调控作用。
P-H…O/N氢键:见于膦类化合物,应用于催化、配位化学。如膦配体的P-H与金属配合物的O原子、膦酸酯分子间的相互作用。键能5~10 kJ/mol,可调控催化剂的活性位点构型。

按氢键强度分类
氢键强度与键长r(H…Y)、键角θ(X-H…Y)直接相关,按强度可分为3类:
(1)强氢键,键能20~40kJ/mol
结构判据:r(H…Y) Å,θ>160 °,含显著共价成分,电子轨道重叠。如HF二聚体F-H…F、羧酸二聚体O-H…O、质子化胺的N-H…O⁻,如NH4+…COO–。可用于质子传导材料、燃料电池电解质、强相互作用超分子组装。
(2)中强氢键,键能5~20kJ/mol
结构判据:2.2 Å≤r(H…Y) Å,120 ° °,以静电作用为主。如水分子间的O-H…O、蛋白质中肽键的N-H…O、醇与胺的O-H…N。可用于维持生物大分子构象、聚合物分子链交联、催化剂与反应物的吸附活化。
(3)弱氢键,键能1~5kJ/mol
结构判据:r(H…Y)≥2.5 Å,θ≤120 °,静电作用较弱,依赖范德华力协同。如C-H…O、C-H…N、S-H…S氢键。可用于晶体堆积中的分子排列、疏水作用中的协同稳定、药物分子与靶点的弱相互作用累积。

按氢键的结构特征分类
(1)分子间氢键
分子间氢键指的是氢键供体与受体属于不同分子,是最常见的类型。如水与乙醇的混合溶液H₂O…HO-C2H5、DNA碱基对间的氢键、聚合物分子链间的氢键。可用于促进分子聚集、提升材料稳定性、调控溶液性质。

(2)分子内氢键
指氢键供体与受体位于同一分子内,通常形成五元环或六元环。如邻硝基苯酚-OH…O2N-,六元环;水杨酸-OH…O=C-,六元环;蛋白质α-螺旋中的肽键内氢键N-H…O=C。可用于稳定分子构象、降低分子极性、调控材料响应性。

(3)多重氢键
指两个分子间通过2个及以上氢键形成“氢键对”或“氢键簇”,协同增强相互作用。如脲基嘧啶酮UPy基团间的四重氢键2个N-H…O+2个N-H…N、DNA碱基对A-T2个氢键,G-C3个氢键、双齿配体与金属离子的氢键簇。
键能具有“协同效应”,总键能大于单个氢键之和,是超分子自修复材料、特异性分子识别的核心机制。

DOI:10.1038/s41467-023-36015-z


氢键强度的经验公式
氢键强度EHB可通过键长、键角等几何参数或红外光谱位移定量估算,常用经验公式:

符号含义:rH…Y为H原子与受体Y原子的距离,Å,关键判据:rH…Y Å通常认为存在强氢键;k、a为经验常数,随X、Y原子类型变化,如X=O、Y=O时,k≈100,a≈0.3;
物理意义:rH…Y越短,氢键强度越大,呈指数相关。

红外光谱位移公式
这是判断氢键形成的核心依据,氢键形成会导致供体X-H键的伸缩振动频率ν红移,红移量Δν与氢键强度正相关:

符号含义:V0为自由X-H键的伸缩振动频率;VHB为形成氢键后X-H键的振动频率,如缔合-OH的ν≈3200~3400 cm⁻¹;c、b为常数,如O-H…O氢键中,c≈0.1、b≈0。
应用:Δν越大,氢键越强,如强氢键的Δν>400 cm⁻¹,中强氢键Δν=200~400 cm⁻¹,弱氢键Δν cm⁻¹。

DFT量化分析
通过密度泛函理论DFT计算可精准获得氢键的键能与电子结构,核心公式:

符号含义:Ecomplex为氢键复合物的总能量;Edonor、Eacceptor分别为供体分子与受体分子的单独能量;EBSSE为基组重叠误差,需校正以提高准确性。
适用场景:通过VASP、Gaussian等软件计算,精准量化氢键强度。
键角判据
氢键的方向性通过键角θ,X-H…Y的夹角描述,理想氢键的θ≈180 °,强度随θ偏离180 °而减弱。强氢键:θ>160 °,rH…Y Å;中强氢键:120 ° °,2.2 Å≤rH…Y Å;弱氢键:θ≤120 °,rH…Y≥2.5 Å。
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