药物设计
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什么是溶剂化结构?
本文华算科技系统探讨了溶剂化结构的关键性质,聚焦于通过理论计算方法(如密度泛函理论(DFT)、分子动力学(MD)和从头算分子动力学(AIMD))解析的热力学和动力学性质。理论计算通…
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如何分析静电势?
说明:本文华算科技系统剖析静电势的理论基础、计算方法、跨学科应用及前沿发展,通过经典模型与案例揭示其在微观机制解析中的关键作用。 静电势(Electrostatic Potenti…
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手性化合物基础:核心概念、构象分析与CIP规则
说明:本部分华算科技将系统阐述手性现象的本质、关键术语(如手性中心、手性轴、手性面、对映体、非对映体)、构象分析(椅式、船式、扭曲式)以及决定构型绝对归属的CIP规则。理解这些基础…
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什么是分子动力学(MD)模拟?
本文将系统解析MD模拟的基本原理、三大核心应用及其在多领域的广泛潜力。 什么是分子动力学(MD)模拟? 分子动力学(MD)模拟是一种基于经典力学的计算方法,通过求解牛顿运动方程,模…
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静电势(ESP)入门:定义、作用及在 DNA 碱基配对中的应用
总结:静电势(Electrostatic Potential, ESP)就像是一张“分子电场地图”,揭示了电子云与原子核共同塑造的电荷分布密码。它告诉我们,分子哪些区域电子密度富集…
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什么是过渡态(Transition State)?化学反应最高能量点、活化能与反应速率关键
过渡态(Transition State)是化学反应中一个非常重要的概念,它描述了反应物转化为产物过程中所经历的最高能量状态。在化学反应中,反应物通过一系列中间状态最终转化为产物,…
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分子偶极矩的定义、特性及其广泛的应用
本文详细介绍了分子偶极矩的定义、特性及其广泛的应用。从分子极性与构型的关系出发,分析了偶极矩在判断分子空间构型中的关键作用。同时,探讨了偶极矩对材料光电性质的影响,如介电常数和折射…
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重磅来袭!药物设计中的生物催化:分子对接指导工程酶改造
一、背景介绍 在创新生物活性小分子的探索之旅中,构建具有独特结构的化合物始终是关键所在。其中,含有多个立体中心的复杂手性分子,无疑是化合物库拓展的宝贵财富。然而,传统的有机合成方法…
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揭秘!分子对接为何成为科研热点,一文带你读懂
一、原理介绍 分子对接是模拟小分子配体与生物大分子受体结合过程的方法。它基于受体结构信息,通过计算预测配体在受体结合位点的最佳位置和方向(最佳构象),使配体-受体相互作用能量最低、…