分子模拟

本文全面探讨了分子力场这一计算化学的核心工具如何描述原子间相互作用并推动分子模拟。 从力场的基本概念、功能形式和参数化挑战入手，详细介绍了传统加和性力场（如AMBER、CHARMM…

水模型的发展经历了从简单的三点电荷模型（如SPC、TIP3P）到引入虚原子（TIP4P、TIP5P）和极化效应（AMOEBA、SWM4-NDP）的迭代优化。这些改进旨在更精确地描述…

GROMACS 是一款用于分子模拟的高性能软件包，最初由荷兰格罗宁根大学的科研团队开发，旨在为化学、生物和材料科学等领域提供高效、准确的分子动力学模拟工具。 经过多年的发展，GRO…