水模型的发展经历了从简单的三点电荷模型(如SPC、TIP3P)到引入虚原子(TIP4P、TIP5P)和极化效应(AMOEBA、SWM4-NDP)的迭代优化。这些改进旨在更精确地描述水的氢键网络、极化响应及极端条件下的物性,为生物分子、界面体系和化学反应模拟提供基础。
在分子模拟中,水是迄今为止最常用也最复杂的溶剂之一。由于其独特的物理化学性质(如高介电常数、异常的密度-温度行为、强大的氢键网络),精确地模拟水对于理解生物分子行为、化学反应、材料性质等至关重要。

水模型的简介
水模型的目的是用一组参数来描述水分子中原子之间的相互作用,以便在分子动力学(MD)或蒙特卡洛(MC)模拟中重现水的宏观和微观性质。一个理想的水模型应该能准确地再现水的密度、扩散系数、蒸发焓、介电常数、结构(径向分布函数)以及温度和压力依赖性等。
水模型的发展历程可以追溯到上世纪70年代,大致可以分为以下几类:

刚性非极化模型 (Rigid Non-polarizable Models):
这类模型假设水分子是刚性的,即键长和键角固定不变。同时,它们不考虑水的极化效应,即水分子的偶极矩是固定的,不随周围电场的变化而改变。水分子间的相互作用通过Lennard-Jones (LJ) 势能函数和库仑势能函数来描述。通常将电荷分配在O原子和H原子上,或者在O原子上添加一个额外的“虚位点”(M site)来放置负电荷。
这是最早发展的水模型,计算效率高,但由于忽略了重要的极化效应,在描述某些性质时存在局限。
SPC (Simple Point Charge):最早期的模型之一。它有3个点电荷(O原子上一个负电荷,两个H原子上各自一个正电荷),LJ中心在O原子上。它在室温下对水的密度和蒸发焓的描述相对较好。

SPC/E (Extended Simple Point Charge):SPC模型的改进版。它通过调整参数,尤其是氢原子的电荷,来更好地再现水的扩散系数和介电常数,同时略微增加了水的偶极矩。SPC/E是目前应用最广泛的水模型之一,计算效率和精度之间取得了很好的平衡。
TIP3P (Transferable Intermolecular Potential with 3 Points):与SPC/E类似,也是三位点模型,LJ中心在O原子上。TIP3P是另一个非常流行的模型,尤其在生物分子模拟中被广泛使用。它的参数经过调整,使其在常温常压下能很好地描述水的密度和一些热力学性质。


TIP4P (Transferable Intermolecular Potential with 4 Points):这是四位点模型,在O原子和两个H原子之外,增加了一个虚位点(M site),通常放置在O-H键的角平分线上,用于放置负电荷。
这种设计更好地模拟了水分子的电荷分布,改善了对液体水结构(径向分布函数)和密度异常的描述。TIP4P系列包括TIP4P/2005、TIP4P/ice等,这些变体通过优化参数来适应不同的应用场景(如TIP4P/ice用于模拟冰的结构)。
TIP5P (Transferable Intermolecular Potential with 5 Points):
五点模型将负电荷放在代表氧原子孤对电子的虚拟原子(标记为L )上,具有类似四面体的几何结构。此类模型的早期模型是 1971 年由 Ben-Naim 和 Stillinger 提出的 BNS 模型,该模型很快被 1974 年 Stillinger 和 Rahman 的 ST2 模型所取代。
主要由于计算成本较高,五点模型直到 2000 年 Mahoney 和 Jorgensen 发表 TIP5P 模型后才得到发展。与早期模型相比,TIP5P 模型改进了水二聚体的几何形状,形成了更“四面体”的水结构,可以更好地再现中子衍射的实验径向分布函数,以及水的最大密度时的温度。TIP5P-E 模型是 TIP5P 的重新参数化版本,可与 Ewald 和一起使用。

水模型的发展与技术演进
从经验参数到多尺度优化
早期经典模型(1980s 前):基于气相实验数据构建,如 SPC(1976)和 TIP3P(1983),通过调整电荷分布和 Lennard-Jones 参数(氧原子 σ=0.3166 nm,ε=0.6502 kJ・mol⁻¹)拟合液态水密度(~1 g・cm⁻³)和汽化热(~40 kJ・mol⁻¹)。
精细化改进阶段(1990s-2010s):针对特定性质优化,如 TIP4P/2005 修正氢键强度,提升冰 Ih 密度预测精度(0.9 g・cm⁻³);柔性模型 SPC/Fd 引入键长波动(均方根偏差~0.001 nm),改善动力学性质(扩散系数~2×10⁻⁹ m²・s⁻¹)。
数据驱动创新(2010s 至今):机器学习赋能模型参数化,如阿贡国家实验室开发的粗粒度模型,通过 10 亿级原子模拟数据训练,同时优化熔点(273 K)、密度最大值(4℃)和冰相界面动力学,计算成本降低 50%。
计算效率与精度的平衡策略
刚性模型:适合大规模体系(如 10⁵水分子)快速模拟,典型时间步长 1 fs,常用于蛋白质分子动力学(如 Amber 力场默认 TIP3P)。
柔性模型:牺牲 20%-30% 计算速度,换取更真实的氢键动态(键角波动 ±5°),适用于溶液中化学反应过渡态研究。
极化模型:引入诱导偶极相互作用(计算量增加 1-2 倍),精确描述离子水合壳(如 Na⁺第一溶剂壳配位数 6.0±0.1)。
水的分子动力学模拟案例
https://doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00794

https://doi.org/10.1039/D0CP00250J

DOI:10.1063/5.0069896
结论
水模型作为分子模拟的核心工具,其发展历程体现了从简化经验到精准预测的技术跨越。未来需突破多性质耦合精度与计算效率的瓶颈,结合机器学习与实验表征,为复杂体系(如细胞膜水通道、水合离子电池)的溶剂化行为提供更可靠的理论支撑。通过持续优化模型参数与算法,水模型将在化学、材料、生物等领域的跨学科研究中发挥更关键的作用。