华算科技朱老师
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VASP | 理论计算常见问题解答-77
Q1:朱老师,请问在计算吸附能的过程中是不是IVDW这个参数也一直保留,在仅计算金属催化剂表面的能量时发现加IVDW和不加有显著差异? A:要么全程都开,要么全程都关;绝不要混用;…
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VASP | 理论计算常见问题解答-76
Q1:朱老师,neb计算时,这个nebef.pl之后第二列全是0? A:一、可能是没有编译好VTST; 二、在计算过渡态之前需要检查原子是否一一对应; 三、第二个这个截图是正常的。…
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VASP | 理论计算常见问题解答-75
Q1:朱老师,计算FE110表面H2的吸附时,需要考虑色散校正开启IVDW=12吗? A:需要开启,H₂在 Fe (110) 表面的吸附通常属于化学吸附,而非纯粹物理吸附; 研究分…
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【基础篇】VASP零基础系统化教程:VASP晶体电荷密度计算!
VASP自洽计算原理 VASP(Vienna Ab initio Simulation Package)是一款基于密度泛函理论(DFT)的量子力学模拟软件,广泛应用于材料科学、化学…
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VASP | 理论计算常见问题解答-74
Q1:朱老师,我算出来的声子谱是这样的是什么原因,有非常明显的虚频? A:若前期结构优化不彻底,原子会存在 自发位移的趋势,声子谱会直接将这种趋势转化为明显虚频,具体表现为: 一、…
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VASP | 理论计算常见问题解答-72
Q1:朱老师,这是我做的二维钙钛矿材料,沿(0 0 1)切面后加了个真空层。主要是想后面做缺陷,再吸附分子做缺陷钝化,这个切面步骤是有必要的吧? A:①切面是聚焦表面 / 界面研究…
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VASP | 理论计算常见问题解答-73
Q1:朱老师,想研究一个二维材料和一个衬底slab模型异质结界面,结构优化是用isif=3还是2? A:优先选ISIF=3,无原子固定用ISIF=3,并且固定真空层方向不做晶胞优化…
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VASP | 理论计算常见问题解答-71
Q1:朱老师,这个报错:“WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV”怎么解决? A:金属表面试试ISMEAR=2 SIGM…
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VASP | 理论计算常见问题解答-70
Q1:朱老师,请问我这个过渡态计算最有可能是过渡态的是哪个点啊 A:如果结构没问题,能量最高点是过渡态 Q2:朱老师,我是要按照这里显示的去下载对应版本的python吗?但我下载好…
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ELF如何帮助识别催化剂的活性位点?
ELF(Electron Localization Function,电子局域函数)是一种用于描述电子在空间中定域程度的数学工具,它通过将体系中的电子云划分为不同的定域区域,直观地…
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【重点】VASP零基础系统化教程:VASP晶体结构优化计算!
VASP结构优化原理 结构优化的核心目标是通过调整原子位置或晶格参数,使体系的总能量达到最小值。在VASP中,这一过程通常通过迭代算法实现,例如共轭梯度法(Conjugate Gr…
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基于电子密度的原子电荷分析:Bader 电荷方法的原理与应用进展
Bader电荷是一种基于电子密度的原子电荷分析方法,由Richard Bader提出,广泛应用于化学、材料科学和计算化学领域。该方法通过将分子或晶体的电子密度划分为原子的“Bade…
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VASP | 理论计算常见问题解答-68
Q1:朱老师,我同一个模型切同一面后,在算功函数时,如何确定那个暴露面最好呢?是通过什么数值来确定的呢? A:根据实验结果哪个是暴露面 Q2:朱老师,这里不同缺陷原子对net …
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VASP | 理论计算常见问题解答-69
Q1:朱老师,我在按照教程里面的进行操作,想要对模型进行切割,“from ase.io import read” 这个命令执行失败,从哪里怎么看库里都有那些…
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【基础篇】VASP零基础系统化教程:Linux基础命令(下)
Linux操作系统介绍 超算平台(超级计算平台)是面向大规模科学计算、人工智能训练、数据分析等高性能需求而构建的综合计算基础设施。超算平台是一类具备海量并行计算节点、快速互连网络和…
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【基础篇】VASP零基础系统化教程:Winscp软件下载超算文件!
超算平台介绍 超算平台(超级计算平台)是面向大规模科学计算、人工智能训练、数据分析等高性能需求而构建的综合计算基础设施。超算平台是一类具备海量并行计算节点、快速互连网络和大容量存储…
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【基础篇】VASP零基础系统化教程:VESTA如何打开CIF文件?
VESTA软件介绍 VESTA是一款三维可视化软件,专用于晶体结构、电子密度和等值面(等势面)的展示与分析。它支持多种文件格式(如CIF、POSCAR、XSF),能够直观地绘制原子…
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VASP | 理论计算常见问题解答-67
Q1:朱老师,想请教一下,我计算的Bader电荷里,化学环境相同的同种元素原子(如图中的4号和5号原子都是环境相同的Cu原子),它们的电荷值差别有点大,可我INCAR参数设置都是按…
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VASP | 理论计算常见问题解答-66
Q1:朱老师,我这种环状结构有机物,我是应该选择其中某一个碳原子吸附到吸附位点上去,还是选择这个环的中心吸附到吸附位点上去呢? A:参照文献 选择,或者都尝试,选择能量最低的 Q2…
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VASP | 理论计算常见问题解答-65
Q1:朱老师,如图2-CTP吸附到氧化铜表面的反应路径图。绿色和红色两条反应路径,都是反应物首先经过一个反应前络合物(吸附中间体),再经过过渡态到达产物。 如果势垒看成是过渡态减去…