VASP问题答疑系列

Q1：朱老师，我在按照教程里面的进行操作，想要对模型进行切割，“from ase.io import read” 这个命令执行失败，从哪里怎么看库里都有那些…

Q1：朱老师，想请教一下，我计算的Bader电荷里，化学环境相同的同种元素原子（如图中的4号和5号原子都是环境相同的Cu原子），它们的电荷值差别有点大，可我INCAR参数设置都是按…

Q1：朱老师，我这种环状结构有机物，我是应该选择其中某一个碳原子吸附到吸附位点上去，还是选择这个环的中心吸附到吸附位点上去呢？ A：参照文献 选择，或者都尝试，选择能量最低的 Q2…

Q1：朱老师，如图2-CTP吸附到氧化铜表面的反应路径图。绿色和红色两条反应路径，都是反应物首先经过一个反应前络合物（吸附中间体），再经过过渡态到达产物。 如果势垒看成是过渡态减去…

Q1：朱老师，我在计算态密度的时候在INCAR中加入了NEDOS=1000，但是算完以后还是默认的301，这是哪里设置的问题吗 A：计算出错或者没有开始 Q2：朱老师，我在建三元异…

Q1：朱老师，关于POTCAR的坐标有一点问题想确认一下①三个基矢是否是在正空间三维直角坐标系的坐标（数值单位是A）②分数坐标系里数字应该是线性组合系数；如果是三斜晶胞，笛卡尔坐标…

Q1：朱老师，请问VESTA里面这个原子显示一半蓝色一半灰色是为啥 A：这是有分数占据的cif,不能用于计算 Q2：朱老师，如果我要算0价和正一价的缺陷形成能，是同时算？还是先结构…

Q1：朱老师，教程里有finite temperature DFT的教程吗？想计算温度对于能带的影响 A：算不了温度对电子结构影响 Q2：朱老师，这个报错是什么原因呢？ A：设置a…

Q1：朱老师，我想问一下要比较表面slab模型在有无氧空位情况下对HER和OER过程产生的影响。可以把没有氧空位情况下优化好的吸附结构拿来，去掉slab中的一个氧，然后用这个结构直…

Q1：朱老师，构建了一种特殊的Pt团簇结构，通过分析在（111）面额fcc位点上O*（氧吸附能）与普通的无修饰Pt particle结构对比，是否可以通过O*氧吸附能更弱（大概少0…

Q1：朱老师，如何解决表面模型，体相为反铁磁材料的初始磁矩的设置问题？ A：表面原子可以用对应位置体相的磁矩 Q2：朱老师，顶部这个情况影响正常的表面结构优化吗，需不需要调一下sl…

Q1： 朱老师，计算bader电荷出现这种情况是计算错了吗？怎么解决呢？ A：没有错，还没算完 Q2：朱老师，怎么在VESTA里设置这个可以直接看原子位置的（X，Y，Z）？ A：v…

Q1：朱老师，我这个配置脚本的话，是在箭头处直接输入视频里的指令吗？ A：任何地方就可以 Q2：朱老师，还有一个问题，就是在做SiLi分子动力学模拟的时候，把NSW改成1000，运…

Q1：这个gcc was not found是需要update gcc吗，还是对计算结果没影响 A：不管他 Q2：朱老师，体系原子构型下每个原子的球对称电荷密度怎么求呢？ A：拆开…

Q1：朱老师，计算出来的焓这一项可以与之前计算的内能比较吗？主要是想说明加压对于吸附能的影响，是无压力和有压力时的内能对比是吧？ A：可以的，是的 Q2：朱老师，DFT能否考虑在有…

Q1：朱老师，请问一开始就出现这种报错应该怎么调呀？ LAPACK: Routine ZPOTRF failed!         309           1         …

Q1：朱老师，晶体空位缺陷形成能要减去单个原子的能量，那么这个能量是这个原子在单质中的能量，还是建一个晶胞中放单个原子的能量呢？ A：晶体中一个原子的能量，选择一个最稳定的单质中的…

Q1：朱老师，我看您在B站上的缺陷讲解，写的是 而这篇文献中讲的是 不知道是怎么回事? A：只是定义不一样，两者等价 Q2：朱老师，在算半导体能带图时为什么会有一部分越过了0点 A…

Q1：朱老师，在建立一系列合金slab模型以后，我想要利用d带中心其吸附能力进行衡量，第一个问题：用总态密度进行d带中心的计算可以得到slab模型的吸附强弱，那么我利用表面不同元素…

Q1：朱老师，可以取周期性结构的重复单元放在晶胞里做吸附计算吗？ A：这样不再是周期性结构，只能用0维来处理，最好用高斯计算 Q2：朱老师，开始算了一点点然后计算就停了，出现这个报…