球差电镜图像处理(过滤、着色)

小编最近送的球差电镜数据出来了,乍一看结果很是不行,原子形状不圆、成像不清晰,甚至还有跳线,再一看,原始数据甚至不能导入DM软件中作处理,急得我组会焦虑症又犯了。

还好!苦战了两个晚上,终于把情况捋清楚了,原来文章上好看的图都是作出来的。组会上我导让我整理一个操作方法,我整理好上传到这儿跟老师同学们一起学习讨论。

球差电镜图像处理(过滤、着色)

1 以上是效果图,可以看到经过处理后的图原子清晰形状完整,且颜色较为美观。

以下操作,均可以在DM软件上完成,需要软件的小伙伴可以后台私信一下公众号哈~

球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)

2~4首先解决导入的问题,我们拿到的TEM数据有些格式直接导入软件会提示不识别。遇到这种情况可以进行数据格式转化,我是把图片导入到“画图软件“,再另存为TIFF格式。

球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)

5~7以这次测试数据为例,格式转换后可以将保存的TIFF文件导入至DM中。之后会发现不能对导入的图片做傅里叶变换操作,我们从左上角工具栏Edit-Change Data Type中将数据形式从RGB改到Integer即可。

球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)

8~10对图像进行傅里叶变换,在得到的傅里叶变换图中可以看出,样品的噪音信号是比较多的,我们需要对噪音信号进行过滤。这里右键FFT图,我们会用到一个Mask的功能(不同版本的DM位置可能不一样)。Mask中有四种方法,我们选择Array,原因是在倒空间中的光斑还是比较多的,用Array可以用阵列的方式标记完所有光斑,更准确以及高效。

球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)

11~13加入Mask后,我们可能会看不清FFT的图像,这时候需要再左边的Display Control栏中修改图像的设置,可以看到修改后光斑变得清晰了。我们将Mask中的两个箭头指向距离中心点最近的两个光斑,并将圆圈大小调节至刚好能覆盖光斑区域。最后点击Process-Apply Mask即可。

球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)

14~15再对经过Mask过滤后的FFT图像进行Inverse FFT,即反傅里叶变换可以得到经过过滤后的原子像,我们把他跟初始图进行对比,可以发现原子形状变得更圆润了,且一些失真的现象消失了;另外注意到原子在图像上的位置是没有发生改变的,且部分区域的明暗变换也保留了下来。说明该操作不影响数据本身的真实性。

球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)
球差电镜图像处理(过滤、着色)

16~19最后我们可以对图像的颜色进行改变(为了图像的美观,在不同的领域以及测试的不同进程中,可以不使用灰度图)。在弹出的Image Info中,我们可以在Color Table中改变图像的颜色。这里的色彩栏是根据信号强度的分布赋予色彩,如果想要原子看起来立体,那需要将色彩栏上面的部分设置浅一些,再从中间由深到浅;如果需要提高原子亮度,则可以将最下面的几行调成同样的白色,再开始渐变。

球差电镜图像处理(过滤、着色)

20具体的颜色设置以自己的实际需求为主,可以多加尝试!整体效果对比如图所示

声明:如需转载请注明出处(华算科技旗下资讯学习网站-学术资讯),并附有原文链接,谢谢!
(0)
上一篇 1天前
下一篇 1天前

相关推荐