单原子催化剂里的吸收原子常被 N、O、S 等轻元素锚定。EXAFS 拟合表中写出的M-N 距离，指金属中心到第一壳层氮原子的平均距离；块体金属箔里的参照峰，主要来自金属原子之间的M-M 近邻这类金属路径。这类区分会改变第一壳层的物理含义。
这两组距离放在同一张 XAFS 图里，物理对象却不同。M-N 是异核配位键，M-M 是金属键；前者受到配体原子半径、电荷转移和配位场约束，后者来自金属晶格中的周期排列。把二者当成同一根键的长短变化，会混掉第一壳层类型。这类区分会改变第一壳层的物理含义。
显微表征确认金属原子是否孤立分散，EXAFS 进一步给出平均近邻类型。单原子亮点周围没有长程金属晶格，第一壳层便转向M-N、M-O 或 M-S 配位。短距离主要来自近邻原子更换，同一种金属键同步缩放无法解释这类差异。这类区分会改变第一壳层的物理含义。
读单原子 XAFS 时要把金属箔参照当作路径识别标尺，把 FePc、CoPc 或硫化物参照当作轻元素配位标尺。参照物换掉后，键长数值的含义也随之改变。这类区分会改变第一壳层的物理含义。
氮原子半径小，电负性较高，和过渡金属形成的配位键常位于 1.8-2.1 Å 一带；许多 Fe、Co、Ni 金属箔的第一近邻 M-M 距离则在 2 Å 以上。M-N 数值偏短，常常是异核配位键这一类成键本身的结果。该变化会改变近边和边后谱线。
XANES 和 FT-EXAFS 放在一组数据里时，边位、白线和 R 空间主峰会一起反映金属价态与局域配位。Fe-N3S1 体系中，FT-EXAFS 主峰夹在Fe-N 路径与 Fe-S 路径之间，拟合结果给出 N 和 S 共同参与的第一壳层。该变化会改变近边和边后谱线。
同一组谱线若放入 Fe 箔、FePc、FeS2 等参照，读到的是不同散射路径的相对位置。Fe 箔给出 Fe-Fe 参照，FePc 给出 Fe-N 参照，硫化物给出 Fe-S 参照。M-N 短于 M-M，更多是在比较两类键。该变化会改变近边和边后谱线。
轻元素配位还会改变金属中心的电荷分布。N 原子把电子在金属和配体之间重新分配，局域配位场固定金属位置，第一壳层距离就由配体场强度、金属价态和位点几何等因素共同决定。该变化会改变近边和边后谱线。
单原子位点没有块体金属中多方向的金属近邻，周围几个配体承担主要锚定作用。配位数降低后，电子密度重新分布，金属中心和配体之间的相互作用更集中，第一壳层常出现局域键长收缩这一结果。这个响应会改变金属中心的局域坐标。
载体曲率、缺陷和杂原子会继续改变这个距离。高曲率碳球上的 Fe-N3S1 位点中，研究者记录到 Fe-N 键受压缩、Fe-S 键被拉伸；FT-EXAFS 路径位置也随曲率发生细小移动。这个响应会改变金属中心的局域坐标。
这里的收缩来自局域几何和电子结构共同响应。曲面碳骨架改变 C-N 网络的弯曲状态，Fe 周围的配位原子位置随之偏移，Fe-N 与 Fe-S 键以不同方向响应同一个局域应变场。这个响应会改变金属中心的局域坐标。
轴向配位牵动金属中心。FeN4 增加轴向 O 后，电子分布、铁自旋态和局域构型都会改变。键长和价态、轨道占据、配体场强度一起变化。这个响应会改变金属中心的局域坐标。
EXAFS 表格中的 R 来自散射路径拟合。研究者设定 Fe-N、Fe-S、Fe-O 或 Fe-Fe 路径，再让配位数 N、距离 R、无序度 σ2 和 ΔE0 共同匹配 χ(k) 与 R 空间谱线。该参数会写入拟合表。
未校正的 FT 主峰位置常短于真实键长，拟合表中的 R 则已经带入散射相位和路径模型。M-N 键长来自表格中的路径参数；单独峰顶距离缺少相位信息。该参数会写入拟合表。
工作态数据还会带来新的近邻。吸附 O、OH 或反应中间体后，金属中心周围会出现M-O 路径，原本的 M-N 配位数会变化。相同 R 区间内常混有多条轻元素路径。该参数会写入拟合表。
同一个拟合距离受 k 范围、R 范围、S02、σ2 和 ΔE0 牵动。可靠的键长比较需要相近的拟合窗口和相同的散射路径名称；路径名称差异会让数值高低失去同一把尺。该参数会写入拟合表。
短 M-N 键代表金属中心和氮配体之间约束较强，但催化活性还取决于吸附中间体、价态变化、导电网络和位点可及程度。键过短时，金属中心会被配体束缚得太强，反应物吸附或产物脱附反而受限。该差异会改变反应中间体的能量。
不同金属没有统一标尺。Fe-N、Co-N、Ni-N、Zn-N 的自然距离不同，同一种金属在 N4、N3S、N5 或轴向 O 配位中对应不同距离。比较键长前，要固定金属元素、配体类型、配位数和拟合路径这几项。该差异会改变反应中间体的能量。
Fe-N5、Fe-N4 和含 S/O 的配位模型给出的轨道占据、自由能和电荷分布存在差异。短键若伴随过强吸附，反应中间体会停留过久；若伴随合适的电子态，才会改善反应步骤。该差异会改变反应中间体的能量。
单原子催化剂的 M-N 距离短于块体 M-M 距离，主要来自三件事：第一壳层换成轻元素配位，低配位环境带来局域收缩，EXAFS 路径模型纳入相位和散射原子类型。键长比较要服务于具体结构，离开路径名称单独排序会丢掉配位对象。该差异会改变反应中间体的能量。
