以VASP软件为例,首先通过晶体结构数据库下载材料的cif文件,在此基础上构建表面、表面吸附分子、孤立分子模型,并生成POSCAR文件,再根据元素顺序构建POTCAR文件,然后编写结构优化的INCAR和KPOINTS文件。准备好这四个文件后即可开始对三个结构进行优化计算。
ICHARG=2 #从原子电荷密度产生体系初始电荷密度
EDIFF=1E-4 #电子波函数能量收敛标准1E-4 eV
IBRION=2 #共轭梯度法优化晶体结构和原子坐标
NSW=200 #晶体结构和原子坐标优化步数最大200步
EDIFFG=-0.1 #原子残余力小于0.1 eV/A
ISMEAR=0 #费米能级附近电子占据数为高斯分布
Automatic generation #注释行
完成三个结构优化计算后,保持KPOINTS,POTCAR文件不变,将CONTCAR文件复制成POSCAR文件,并对结构优化的INCAR文件作如下修改,从而获得三个结构的能量:
将表面吸附分子总能减去表面和孤立分子的总能,即可得到吸附能,对应的结构即为吸附构型。
其中,Eslab 是表面结构的能量,Emolecule 是吸附分子的能量,Eslab+Emolecule 是表面吸附分子后的总能量。
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