机器学习与数据驱动

说明：本文华算科技主要介绍原子间势函数的能量定义、势能与受力的关系、双体和多体作用，以及势函数对材料性质的描述范围。 势函数的定义：从原子构型到势能 给定一块铜晶体中全部原子的位置…

研究背景 异相催化作为现代化学工业的核心技术，在能源转换、环境保护和化工合成等领域发挥着不可替代的作用。传统上，密度泛函理论（DFT）计算被广泛应用于催化机理研究和催化剂设计，但其…

说明：本文华算科技介绍了机器学习势函数的基本概念与计算化学视角下的关键要素，说明了如何用高精度量子数据训练模型以在大尺度模拟中近似第一性原理精度。 文章讨论了训练数据、原子描述与模…

说明：本文华算科技系统阐述了分子对接技术的定义、核心应用（如药物虚拟筛选与机制研究）、主要分类及标准操作流程。 通过阅读，您将掌握这一强大的计算机辅助药物设计工具，学会如何利用它来…

说明：在蛋白质研究领域，准确预测活性位点对于解析蛋白质功能、药物设计等至关重要。 以下六大专业网站为该领域提供了有力工具：CASTp可定位并测量蛋白质表面口袋与内部空腔的几何参数，…

高通量筛选（High-Throughput Screening, HTS）是一种现代科研中不可或缺的技术，广泛应用于药物研发、基因组学研究、材料科学等领域。 其核心在于通过自动化设…

摘要 SARS-CoV-2的主蛋白酶（SC-2 Mpro）是一种同源二聚体。然而，Shaw课题组近期进行的一项0.1 ms长的分子动力学模拟（DESRES模拟）表明，Mpro从固态…

一、原理介绍 虚拟筛选（Virtual Screening, VS）是一种借助计算机技术，从海量化合物库中寻找可能与药物靶点（通常是蛋白质受体或酶）结合的小分子的过程。 分类 1、…

一、背景介绍 在创新生物活性小分子的探索之旅中，构建具有独特结构的化合物始终是关键所在。其中，含有多个立体中心的复杂手性分子，无疑是化合物库拓展的宝贵财富。然而，传统的有机合成方法…

一、原理介绍 分子对接是模拟小分子配体与生物大分子受体结合过程的方法。它基于受体结构信息，通过计算预测配体在受体结合位点的最佳位置和方向（最佳构象），使配体-受体相互作用能量最低、…

一、PDB数据库 简介 蛋白质结构数据库（Protein Data Bank，PDB）自1971年创建以来，已成为国际上最著名且最完整的蛋白质三维结构数据库。PDB数据库收录了通过…

一、原理 1、共价抑制剂 共价抑制剂通过与靶蛋白形成(不)可逆的共价键，显著增强与靶标的亲和性，从而表现出高生物活性。这种结合方式不仅提高了药物的结合活性和效率，还延长了对靶点的作…

差分电荷密度图是什么？ 差分电荷密度图是一种通过计算材料体系的总电荷密度与其组成原子在孤立状态下的电荷密度叠加之差，以图形化方式展示电荷重新分布情况的分析工具。其核心定义可表述为：…