Q1:朱老师您好,请问AIMD恒温模拟判断体系是否稳定有没有什么标准呀?这个体系是二维稀土碘化物,能量波动在2eV左右,能说明它是稳定的吗?
A:看能量和时间,图片上已经可以稳定了,能量没有上升或者下降趋势就可以
Q2:朱老师请问一下,我在做原子表面优化时,EDIFF 的值已经到达了,但是SCF 还是接着算。请问我是继续等它算到完,还是可以停止计算、并提取EDIFF 已经到达时的能量?
A:接着算,ediffg还没有到,所以还在算
Q3:朱老师,氮化碳光解氢文献用Pt作为共催化剂建模时,Pt原子要怎么放,放1个pt原子在CN上面,然后H*是与Pt作用吗?
A:是的,吸附在pt上,选择能量最低位置
Q4:朱老师,我做这个自洽计算出现了这个问题该咋办啊?
A:换下algo试试
Q5:朱老师,请问对于好几种结构在进行结构优化时都出现了aborting loop because EDIFF is reached,而没有出现reached required accuracy – stopping structural energy minimisation,一般是什么原因导致的呢?
A:还没算完,接着算
Q6:朱老师,反应过程产生自由的SO4根; 这时候E ZPE TS的计算怎么处理;分别计算吗 *HO2 和 SO4根; 还是SO4放在真空层,远离催化剂的地方合在一起计算?
A:负离子的计算方法参考课上oh根的做法,不是直接算的
Q7:朱老师,用CN光解氢; 做H吸附时,放在CN的上方,结构不收敛,所有原子都不共面了(疑似散架); 是因为H要跟CN共面吗? 一般放在什么地方?
A:不共面是正常的,能量更低,可以考虑吸附在n附近边缘n
Q8:朱老师,请问吸附水章节中,这个NEB是cl NEB 还是NEB的方法?其次这个脚本计算之后 的CONTCAR就是吸附水分子的过渡态是吗?
A:cineb,中间图是水分解过渡态,两个contcar是初态和末态
Q9:朱老师,课上讲了可以尝试算频率以及去除虚频的方式(grep -A36 “102 f/i” (X,y,z)+系数X位移的方式重新获得过渡态并计算频率), 如果出现几个都只有一个虚频的结构 这时候应该怎么判断哪一个是真实的过渡态?
A:虚频最大一般是过渡态
Q10:朱老师,像我这样算氧吸附后,吸附位点会翘起来是什么问题?
A:正常的,变成sp3成键了
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