VASP电荷密度计算流程

VASP自洽计算原理

VASP（Vienna Ab initio Simulation Package）是一款基于密度泛函理论（DFT）的量子力学模拟软件，广泛应用于材料科学、化学、物理学等领域。

其核心计算方法之一是自洽场（Self-Consistent Field, SCF）算法，解决Kohn-Sham方程，该算法通过迭代计算电子波函数和密度，直到系统达到自洽状态。

自洽计算是VASP计算中最基础也是最重要的步骤，其目的是找到电子波函数和相应的总能量，使得电子在晶胞中的分布达到自洽。

自洽计算通常包括电荷密度的初始化、波函数的迭代优化以及能量和力的计算。

准备工作

VASP计算需要准备超算连接软件EASYCONNECT与SSH，建模软件VESTA，超算连接软件Winscp。

VESTA软件下载链接

jp-minerals.org/vesta/en/download.html

EASYCONNCT软件下载链接

EasyConnect下载-EasyConnect最新版下载V7.6.7.0

Winscp软件下载链接

Downloading WinSCP-6.5.3-Setup.exe :: WinSCP

VASP输入参数说明

INCAR文件：

ISTART=0 #开始新的任务,随机产生初始波函数

ICHARG=2 #开始新的任务,从原子电荷密度产生体系初始电荷密度

PREC=M #计算精度，决定ENCUT

ISPIN=1 #关闭自旋极化

ALGO=N #确定电子优化的算法

NELM=60 #电子波函数最多计算60步

EDIFF=1E-5 #相邻两步电子迭代的能量差收敛标准

ENCUT=400 #平面波截断能400 eV

IVDW=11 #考虑范德华力修正

IBRION=2 #共轭梯度算法，适用于结构优化

NSW=100 #离子弛豫的步数

ISIF=3 #控制晶格变化,晶格常数优化

EDIFFG=-0.1 #离子弛豫的force的收敛标准

ISMEAR=0 #费米能级附近电子占据数为高斯分布，适合金属、半导体、绝缘体

SIGMA=0.1 #高斯分布展宽0.1 eV

LORBIT = 10 #局域态密度

KPOINTS文件：

Automatic generation #注释行

0 #自动产生K点网格

G #布里渊区K点网格以Gamma点为中心

5 5 5 #K点网格密度

0 0 0 #K点网格中心平移矢量

MgO电荷密度计算

第一步，复制结构优化的CONTCA R，KPOINTS，POTCAR文件

进到之前结构优化的位置，确认一下结构优化已经完成

cd crystal/mgo/opt

将结构优化的文件夹变成自洽计算的文件夹

把它命名成s，进到 s 里面把 CONTCAR 复制成POSCAR

cd ..

cp -r opt s

cd s

cp CONTCAR POSCAR

第二步，修改结构优化的 INCAR 文件

修改 INCAR 文件，让 VASP 执行自洽计算

vi INCAR

第三步，提交自洽计算

sbatch JOB

使用 squeue 命令来看任务队列，已清空。

计算完成后查看输出文件output

cat output

第四步，用VESTA读取输出文件CHGCAR并绘制电荷密度图

算完之后下载输出的CHGCAR文件。进到刚才自洽计算的文件夹 crystal/mgo/s,下载CHGCAR

用 VESTA 打开CHGCAR

给结构图做一个简单的修饰，加上化学键。

修改电荷，在isosurfaces面板中有一个等值面

空间当中电荷密度大于该数值的，会显示这种电荷云

把它叫做CHAGCAR.png 保存。

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