HER台阶图能准确描述催化剂催化HER过程的性能,主要包括H吸附与自由能计算。华算科技朱老师将详细介绍单原子催化剂催化HER的计算流程和数据处理方法。
首先通过晶体结构数据库下载层状材料石墨的cif文件,并生成POSCAR文件,然后把4个临近的C原子替换成N原子,并把中间2个C原子换成金属原子,得到单原子结构,再加入H原子,得到吸附H结构,如下图所示。对吸附H结构进行优化计算。
然后编写结构优化的INCAR和KPOINTS文件。
ICHARG=2 #从原子电荷密度产生体系初始电荷密度
EDIFF=1E-5 #电子波函数能量收敛标准1E-5 eV
IBRION=2 #共轭梯度法优化晶体结构和原子坐标
NSW=100 #晶体结构和原子坐标优化步数最大100步
EDIFFG=-0.1 #原子残余力小于0.1 eV/A
ISMEAR=0 #费米能级附近电子占据数为高斯分布
Automatic generation #注释行
完成结构优化计算后,保持KPOINTS,POTCAR文件不变,将CONTCAR文件复制成POSCAR文件,并对结构优化的INCAR文件作如下修改,从而获得体系的总能E
完成结构优化计算后,保持KPOINTS,POTCAR文件不变,将CONTCAR文件复制成POSCAR文件,并对结构优化的INCAR文件作如下修改:
在POSCAR中固定催化剂原子,也就是在原子坐标后加上FFF,放开吸附的H原子,也就是在原子坐标后加上TTT,并加上选择动力学标签。
完成振动计算后,下载原子振动频率计算的OUTCAR文件,用脚本获得ZPE和TS,并得到吉布斯自由能G=E+ZPE-TS
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