VASP计算HER台阶图应用案例

HER台阶图能准确描述催化剂催化HER过程的性能,主要包括H吸附与自由能计算华算科技朱老师详细介绍单原子催化剂催化HER的计算流程和数据处理方法

结构优化

首先通过晶体结构数据库下载层状材料石墨的cif文件,并生成POSCAR文件,然后把4个临近的C原子替换成N原子,并把中间2个C原子换成金属原子,得到单原子结构,再加入H原子,得到吸附H结构,如下图所示。对吸附H结构进行优化计算。
VASP计算HER台阶图应用案例
VASP计算HER台阶图应用案例
然后编写结构优化的INCAR和KPOINTS文件。
INCAR文件:
ISTART=0    #随机产生初始波函数
ICHARG=2  #从原子电荷密度产生体系初始电荷密度
PREC=M   #计算精度为Medium
ISPIN=2   #打开自旋极化
ALGO=N  #DAV算法优化电子波函数
NELM=60   #电子波函数最多计算60步
EDIFF=1E-5  #电子波函数能量收敛标准1E-5 eV 
ENCUT=400  #平面波截断能400 eV
IVDW=11   #考虑范德华力修正
IBRION=2   #共轭梯度法优化晶体结构和原子坐标
NSW=100   #晶体结构和原子坐标优化步数最大100步
ISIF=2   #优化原子坐标
EDIFFG=-0.1  #原子残余力小于0.1 eV/A
ISMEAR=0   #费米能级附近电子占据数为高斯分布
SIGMA=0.1  #高斯分布展宽0.1 eV
VASP计算HER台阶图应用案例
KPOINTS文件:
Automatic generation  #注释行
0  #自动产生K点网格
G   #布里渊区K点网格以Gamma点为中心
1 11  #K点网格密度
0 0 0  #K点网格中心平移矢量
VASP计算HER台阶图应用案例

自洽计算

完成结构优化计算后,保持KPOINTS,POTCAR文件不变,将CONTCAR文件复制成POSCAR文件,并对结构优化的INCAR文件作如下修改,从而获得体系的总能E
IBRION=-1  #固定结构和原子位置保持不变
NSW=0  #仅作一步自洽计算
VASP计算HER台阶图应用案例

原子振动频率计算

完成结构优化计算后,保持KPOINTS,POTCAR文件不变,将CONTCAR文件复制成POSCAR文件,并对结构优化的INCAR文件作如下修改:
IBRION=5  #有限位移法计算
NSW=1  #仅作一步自洽计算
NFREE=2 #中心差分法计算回复力
POTIM=0.015 #有限差分法步长
VASP计算HER台阶图应用案例
在POSCAR中固定催化剂原子,也就是在原子坐标后加上FFF,放开吸附的H原子,也就是在原子坐标后加上TTT,并加上选择动力学标签。
VASP计算HER台阶图应用案例

数据处理

完成振动计算后,下载原子振动频率计算的OUTCAR文件,用脚本获得ZPE和TS,并得到吉布斯自由能G=E+ZPE-TS
VASP计算HER台阶图应用案例
点击解锁VASP计算HER台阶图全流程技巧👉:获取《VASP计算HER台阶图合集》
【做计算 找华算】
🏅 华算科技提供专业的第一性原理、分子动力学、生物模拟、量子化学、机器学习、有限元仿等代算服务。
🎯500+博士团队护航,累计助力5️⃣0️⃣0️⃣0️⃣0️⃣➕篇科研成果,计算数据已发表在Nature & Science正刊及大子刊、JACS、Angew、PNAS、AM系列等国际顶刊。 👏👏👏

声明:如需转载请注明出处(华算科技旗下资讯学习网站-学术资讯),并附有原文链接,谢谢!
(0)
上一篇 1天前
下一篇 1天前

相关推荐