提问🙋：我的结构是MOF-uio66中截取的团簇，包含元素Zr、元素C、元素O、元素H，我想用Gaussian进行结构优化，帮我生成一份输入文件模板，基组要选择合理，在linux系统下提交计算，节点是48核。
以下是适用于UiO-66 MOF 团簇（含 Zr、C、O、H）结构优化的Gaussian 输入文件模板，基于B3LYP 泛函和混合基组（Zr 使用赝势基组，C/O/H 使用全电子基组），适配 48 核 Linux 计算节点：
输入文件模板 (uio66_opt.gjf)：
%chk=uio66_opt.chk
%mem=64GB ! 内存分配（根据团簇大小调整，建议 ≥64GB）
%nprocshared=48 ! 48核并行计算
# opt b3lyp/genecp ! 结构优化 + 混合基组定义
UiO-66 MOF Cluster Optimization (Zr/C/O/H)
0 1 ! 中性单重态（电荷和自旋根据实际调整）
[在此粘贴 Zr、C、O、H 的笛卡尔坐标]
! 坐标示例（需替换为实际结构）：
! Zr 0.000 0.000 0.000
! O 1.500 0.000 0.000
! C 2.000 1.400 0.000
! H 2.500 2.500 0.000
[空行] ! 必须保留空行分隔
Zr 0 ! 定义 Zr 的基组和赝势
LANL2DZ
****
C O H 0 ! 定义 C、O、H 的基组
6-31G(d)
****
[空行] ! 文件结束符
关键说明：
1. 基组选择：
– Zr 原子：LANL2DZ（含赝势，适合过渡金属 Zr，平衡精度与效率）。
– C/O/H 原子：6-31G(d)（含极化函数，精确描述有机配体和氢键）。
2. 计算参数：
– 泛函：B3LYP（广泛用于 MOF 体系，兼顾金属-有机相互作用）。
– 设置：%nprocshared=48和 %mem=64GB适配 48 核节点（根据实际内存调整）。
3. 结构要求：
– 需提供团簇的 笛卡尔坐标，可通过 GaussView 或 VESTA 导出。
– 确保 Zr₆簇与有机配体（如对苯二甲酸）连接正确，避免孤立原子。
使用步骤：
1.生成坐标：
– 用建模软件（如 GaussView）构建 UiO-66 团簇，导出原子坐标。
– 将坐标粘贴到 [在此粘贴 Zr、C、O、H 的笛卡尔坐标]` 部分。
2. 提交计算：
# 提交命令（假设 Gaussian 16 安装为 g16）
g16 < uio66_opt.gjf > uio66_opt.log
3. 监控任务：
– 检查 uio66_opt.log文件中的优化收敛状态。
请根据实际团簇结构补充坐标后提交计算！
具体操作步骤：
1、新建文档，模板粘贴进去
2、导出坐标mol文件，通过Gauss View打开，然后save as为gjf文件
3、将坐标部分粘贴到模板的笛卡尔坐标位置，注意保留空行
4、将文件改为gjf即可通过gauss View打开
成功学会！