如何通过Materials Studio测量原子到表面的距离

我们之前跟大家分享过如果使用Materials Studio软件测量结构中两个原子间的距离。

很多时候,我们还需要测量一个原子到某个表面的距离,如果直接测量该原子和任意一个表面结构上的原子间距离并不能代表原子到表面的垂直距离。接下来,我们给大家分享下一具体的解决方法。

如何通过Materials Studio测量原子到表面的距离

1. 打开Materials Studio软件,选择Create a new project,并点击OK按钮。

如何通过Materials Studio测量原子到表面的距离

2. 新建一个distance.stp的项目,并点击OK按钮。

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3. 导入一个需要测量的结构文件,示例为MoS2.cif。

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4. 3D视图窗口空白区域右键单击选择Display Style,并在Display Style窗口中选择Ball and stick球棍显示模型,最后选择快捷栏中的calculate bonds按钮,显示键。

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5. 菜单栏中选择build下拉选择Symmetry,并选择其中的Supercell,打开Supercell窗口,并在Supercell窗口中把AB分别设置成2,点击Create Supercell按钮,生成2×2×1超胞结构。

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6. 框选图中同一平面上的S原子。并选择快捷栏中的Create centroid旁边的三角,下拉选择Best Fit Plane,即可生成选中S原子的平面。

如何通过Materials Studio测量原子到表面的距离
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7. 选择快捷栏中的Distance,然后分别选择需要测量的原子和生成的表面,即可得到原子与该表面的距离。

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