掺杂建模怎么做?周期性第一性原理计算全流程指南

说明:本文华算科技主要介绍周期性第一性原理计算中,如何把掺杂对象转成可比较的原子模型,以及构型枚举、形成能和弛豫验收各自约束哪些判断。

掺杂建模怎么做?周期性第一性原理计算全流程指南
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掺杂模型包含哪些计算对象?

一个可比较的掺杂模型由母相晶体、掺杂元素、占位方式、原子数和周期重复方式共同定义。母相应采用明确的晶型、空间群与化学计量;多晶型材料若省略相名,替位位置和局域配位会随母相改变。体相模型用三维周期超胞描述晶格内部掺杂,表面模型则包含晶面、层数、固定层和真空区。两类模型的原子环境不同,所得形成能不在同一组参照中直接排序。

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图1. MAPbI3 从原胞扩展至 2 × 2 × 2 超胞,并设置分子取向、八面体畸变、替位与间隙金属构型。DOI:10.1021/acsomega.5c09558

母相结构宜在同一交换关联泛函、赝势与磁性设置下完成弛豫,再从弛豫后的晶胞扩展超胞。若直接采用实验晶格常数构造掺杂体、却用理论弛豫母相计算能量差,晶格应变会混入掺杂能量。含分子取向、部分占位或低对称畸变的晶体,还需给出母相微观构型;相同化学式并不对应唯一原子排列。

掺杂浓度来自超胞中的离散原子数。以一个掺杂原子替换含 Nsite 个等价母体位点的超胞时,位点分数为 c = 1/Nsite;间隙掺杂则应写明每个化学式单元或每单位体积的原子数。超胞尺寸既设定浓度,也设定相邻周期像之间的距离,二者不可从同一次计算中分离。

图 1 中的 MAPbI3 案例把同一化学式展开为具体原子模型:2 × 2 × 2 超胞承载一个金属掺杂原子,MA 分子取向与 PbI6 八面体畸变则决定掺杂中心周围的初始配位。替位位点和间隙位点对应不同原子收支,后续形成能中的化学势项也随之改变。

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候选构型怎覆盖位点/浓度/局域配位?

替位模型应按母相的 Wyckoff 位置和化学环境枚举。空间群操作能够互相映射的位点只保留一个代表;表面、空位或已有掺杂会破坏原有对称性,原先等价的位点可能分成多组。间隙位可从四面体孔、八面体孔、层间空腔和配位多面体中心生成,并删除距离过短或化学上明显重叠的初始坐标。候选集合记录的是对称不等价局域环境,不以任意挑选的一个原子编号代替位点搜索。

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图2. 3 × 3 × 2 ZnO 超胞中的 2LiZn、LiZn + Lii 及不同四面体、八面体间隙组合。DOI:10.1039/C8RA04811H

含两个及以上掺杂原子的模型还包含缺陷间距与相对方位。最近邻构型可形成局域配位复合体,远距构型用于估计较弱的相互作用;两个掺杂原子沿 a 轴分离和沿 c 轴分离,在各向异性晶体中也可能具有不同能量。ZnO 案例中的 LiZn、Liioct 与 Liitet 给出六种原子排列,弛豫后再识别它们是否保持原占位类别。

一个固定浓度只对应一个周期阵列。2 × 2 × 2、3 × 3 × 3 与 4 × 4 × 4 超胞会改变掺杂比例、弹性畸变范围和静电周期像距离。比较尺寸时,应保持泛函、赝势、能量截断、k 点密度和弛豫标准一致,并把每个构型的形成能换算到相同缺陷计数。大超胞中的 k 网格可以相应变稀,比较依据是倒空间采样密度与总能差的收敛。

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图3. Li 掺杂 ZnO 构型形成能随掺杂浓度变化,实心与空心符号分别对应未作和作偶极修正的结果。DOI:10.1039/C8RA04811H

图 3 的实心点在低浓度区仍明显漂移,偶极修正后的空心点才逐渐接近平坦。这里的差值来自掺杂诱导偶极矩在周期阵列中的长程耦合。若候选构型的能量排序随超胞增大反复互换,当前尺寸仍含显著周期像作用,最低能构型的归属尚未收敛。

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哪些能量比较能区分候选模型?

原子组成相同的构型可比较弛豫后总能;替位、间隙和空位复合体的原子数不同,能量式要计入原子库。常用定义为 ΔEf(Dq) = Etot(Dq) − Etot(host) − Σiniμi + q(EF + EVBM + ΔV) + Ecorr。这里规定加入超胞的原子 ni 为正,移出为负。符号约定、化学势和电荷修正必须与每个数值一同保存,否则不同来源的形成能无法复算。

μi 受到母相稳定区与竞争相约束。富 A 和贫 A 条件对应化学势窗口的不同端点,并会改变 A 位替位掺杂的形成能截距。带电缺陷还随费米能级 EF 改变:斜率等于电荷态 q,折线交点给出热力学电荷转变能级。中性缺陷的水平线与带电缺陷的斜线承担不同物理含义,某个费米能级处的最低线段才对应该条件下占优的电荷态。

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图4. MAPbI3 中 Ni、Cu、Ag、Au 替位与间隙构型的形成能随电子化学势 μe 变化。DOI:10.1021/acsomega.5c09558

带电超胞在周期重复中含有虚假的缺陷—缺陷静电作用,均匀补偿背景只保证总电荷可计算。势能对齐 ΔV 与有限尺寸修正 Ecorr应采用匹配材料介电响应和超胞形状的方案;各向异性介电张量不宜替换为未经检验的单一标量。尺寸测试可观察修正后形成能、远离缺陷区的平均静电势及局域电荷密度是否趋于稳定。

形成能排序描述给定原子库与电子库下的平衡端点,占位转换另由迁移势垒控制。若制备过程先生成间隙掺杂,间隙原子进入替位位置可能经历踢出母体原子、空位协同或表面扩散。HfO2 中 Al 的间隙态与替位态能量接近时,两端能量和转换势垒分别限定平衡占位与热处理可达占位

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图5. Al 掺杂 HfO2 的替位与间隙构型、浓度相关能量差及占位转换势垒。DOI:10.1038/s41524-025-01908-8
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弛豫后模型怎完成结构/电子态验收?

初始坐标只标记搜索起点。结构弛豫可能使间隙原子迁移到另一空腔,使替位原子偏离母体位点,也可能诱发邻近原子重构。验收时应从弛豫坐标重新计算掺杂—近邻键长、配位数、局域体积和缺陷间距,并核对残余力与应力。多个初始微扰若收敛到同一局域结构,可减少高对称鞍点被误作稳定构型的风险;收敛到不同极小值时,各极小值都应保留能量和自旋记录。

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图6. 含替位与空位缺陷的 MoS2 未弛豫结构、DFT 弛豫结构和 DefiNet 预测结构。DOI:10.1038/s41524-025-01728-w

MoS2 案例中,未弛豫结构在替位原子和空位附近保留规则键网,DFT 弛豫后出现明显键长重排。位点名称应以弛豫后的局域几何为准;若间隙原子与母体原子成键并把后者推出原位,原模型已经转化为缺陷复合体,原先的“单间隙掺杂”标签不再描述实际原子结构。

电子态验收采用弛豫后的同一几何结构。过渡金属或开壳层掺杂可设置多组初始磁矩,比较收敛后的总能、局域磁矩和自旋密度。差分电荷密度记录空间重排,原子分区电荷给出选定分区方案下的积分值;缺陷态波函数与投影态密度用于确认带隙内态由掺杂原子、近邻原子还是母相带边贡献。DOS 比较应统一能量零点、展宽和归一化方式,避免把原子数差异误写成态密度增强。

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图7. 未掺杂及 Ni、Cu、Ag、Au 掺杂 MAPbI3 的归一化总态密度与分波态密度。DOI:10.1021/acsomega.5c09558

图 7 将每个模型的 DOS 按原子数归一化,红色虚线为费米能级,蓝色虚线为价带顶。Ni 掺杂在带隙附近出现较强局域态,Cu、Ag 与 Au 的近费米能级贡献各不相同。占位构型、价态和自旋态改变时,缺陷能级位置随之改变;电子结构计算应沿用形成能筛选后保留的具体构型。

超胞从小到大时,可跟踪相对形成能、局域磁矩、缺陷能级和远区平均静电势。能量排序仍随尺寸反转时,扩大掺杂中心间距;缺陷能级随 k 网格明显漂移时,提高布里渊区采样;不同初始自旋收敛到不同极小值时,分别比较总能与自旋密度,直至候选构型的能量次序在预设误差内保持一致。

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