本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:在Materials Studio中进行卟啉分子建模的详细过程。首先,创建新工程并新建3D原子结构文档,通过绘制工具绘制五元环并改变一个碳原子为氮原子。接着,复制粘贴平移和旋转片段,制作了该片段的三个副本。然后,使用碳桥将片段连接在一起,并编辑化学键的类型,添加氢原子,使用clean工具设置结构。同时,介绍了在Materials Visualizer中可以更改的显示样式。接着,讲解了如何进行结构的重叠与对齐,包括导入结构、选择结构、对齐主轴等操作。最后,视频还介绍了如何使用精确定位和对齐工具,如在分子筛框架的主通道中放置一个绿带甲烷分子。整个教程详细展示了如何精确移动原子。
MS杨站长,曾就职于德国马克思普朗克研究所,日本WPI研究所,并曾在芬兰阿尔托大学进行长期访问,作为独立PI主持日本与欧盟多项科研项目。拥有15年Materials Studio、Quantum ESPRESSO、VASP、CP2K、LAMMPS等软件深度使用与教学经验!
往期学员已在Nature子刊、JACS、Angew、AM、AEM等顶级期刊发表论文,成果斐然!
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