分子动力学
-
氢键脚本2.0！分子动力学发顶刊必备！
科研人写论文离不开坚实的理论支撑，而学习DFT计算，还真少不了脚本的帮助！ 其中，氢键脚本在各大领域中出场率极高，杨老师此前创作的氢键脚本，被学员下载超过10000次。 还有不少人…
-
什么是自组装分子动力学模拟?
自组装分子动力学模拟是一种利用分子动力学方法研究分子在无外力作用下通过非共价相互作用（如范德华力、氢键等）自发组织成有序结构的模拟技术。它广泛应用于研究纳米材料、生物分子、聚合物等…
-
膜材料模拟中的分子动力学手段：扩散轨迹、径向分布函数及传输特性分析
膜分离技术在水处理、气体分离和能源回收等领域具有重要应用，常见的膜材料包括石墨烯、金属有机框架（MOF）、共价有机框架（COF）和聚合物膜。 分子动力学模拟为研究膜材料的分子层次特…
-
如何计算离子迁移扩散？
离子迁移扩散计算通过DFT、分子动力学等方法揭示材料中离子输运的微观机制（如能垒、协同迁移），指导固态电解质和电池电极设计。 多尺度模拟（静态能垒分析、动态轨迹捕捉）与机器学习结合…
-
为何选择MD？分子动力学模拟在电解液研究中的应用
基本原理与核心概念 分子动力学（MD）模拟基于牛顿运动方程，通过追踪每个原子的轨迹来揭示体系的动态行为。其核心在于ergodic定理的适用性，即体系的时间平均与系综平均等价[7]。…
-
NAMD非绝热分子动力学的原理与计算方法
非绝热分子动力学（Non – adiabatic Molecular Dynamics，NAMD）是在分子动力学基础上，考虑了电子态之间非绝热跃迁过程的一种计算方法，用…
-
分子动力学模拟：原理、步骤、软件、方法！
在微观世界中，分子的动态行为如同一场精妙的舞蹈，深刻影响着物质的性质和功能。分子动力学模拟（Molecular Dynamics, MD）作为探索分子尺度奥秘的强大工具，是一种基于…
-
如何通过RDF分析材料结构？
本文系统介绍了径向分布函数（RDF）的定义、数学表达及其在分子动力学（MD）模拟中的核心作用。 RDF通过量化粒子间距的概率分布，能够揭示材料短程有序性和长程无序性特征，成为解析微…
-
分子动力学模拟（Molecular Dynamics, MD）
分子动力学模拟（Molecular Dynamics, MD）是一种通过经典力学方法研究原子和分子随时间演化行为的计算模拟技术。 其基本思想是根据牛顿第二定律，利用原子间相互作用的…
-
如何研究氢键？
氢键统计 在分子动力学（MD）模拟中，氢键统计通常基于几何准则进行判断：当供体原子（如O-H）与受体原子（如O或N）之间的距离小于设定阈值（一般为0.30–0.35 nm），且供体…
