分子动力学

  说明：本文华算科技介绍了金属-载体相互作用（MSI）的定义、作用机制、对催化性能的影响、表征MSI的多种技术。MSI通过电子、几何和化学键合效应优化催化剂的活性、选择性和稳定性…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：如何在Materials Studio中使用虚晶近似（VCA）模拟掺杂材料，通过调整composition设置实现原子部分占位（…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：Materials Studio中MONICA、HER、WAP三种原子电荷计算方法的区别：MONICA基于原子轨道线性组合分割电…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：如何使用Materials Studio Forcite分子动力学脚本“Select Same Molecules”从混合物中精…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：MS掺杂脚本2号在高熵合金、高熵氧化物和随机空位建模中的应用。杨站长详细演示了如何使用脚本进行掺杂建模，包括二元合金和多元高熵体…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：绕片段间氢键的多维度分析展开。内容涵盖氢键概率分布函数（PDF）计算，以及氢键数量、键长、键角随时间的动态变化规律解析，脚本适用…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：片段间氢键Hbond长度、角度、数量的概率分布函数PDF及随时间演化，固液界面，溶液，蛋白质，聚氨酯 MS杨站长，曾就职于德国马…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：如何使用Materials Studio脚本绘制分子质心运动轨迹，适用于锂/锌离子电池及生物计算分析。操作简单，选中目标分子原子…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：使用Materials Studio脚本计算局域扩散系数的方法。首先，通过固定目标分子并记录其受到的力，研究者可以分析特定区域内…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：MS氢键统计脚本HBonds.pl的使用与扩展。杨站长将官方提供的50行脚本扩展到300多行，增加了功能，使其能够统计氢键的键长…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：使用Materials Studio分子动力学模拟锂离子在固态/液态电解质中的迁移轨迹，通过脚本提取XYZ坐标、Origin优化…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：如何使用Materials Studio脚本绘制离子迁移路径图，通过XYZ_structure脚本提取轨迹数据，结合周期性边界条…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：关于分子动力学的三个脚本分享。首先，介绍了如何使用脚本绘制分子运动轨迹，通过实例展示了钠离子和氯离子在水中的布朗运动。其次，讲解…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：手动设置作业名称避免空格问题，通过重定向输出到指定文件记录运行信息，并强调根据作业管理系统调整脚本内容，确保高效提交与执行计算任…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：export命令设置环境变量如BELVIA_DIR，并将程序路径加入PATH环境变量，确保命令可直接调用。同时需指定临时文件夹路…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：如何使用Materials Studio的Forcite进行分子动力学MD轨迹分析，特别是如何计算镜像分布函数（RDF）。通过定…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：如何利用Materials Studio Forcite软件通过自定义脚本计算配位数，结合镜像分布函数分析锂-氧原子间的配位关系…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：如何在Materials Studio Forcite中为分子动力学轨迹施加电场，通过修改脚本参数设置001方向电场强度1，并演…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：电荷差分密度图沿z轴分布的原理与绘制方法。通过脚本对不同Z值进行统计，得到电荷差分密度的分布图。以二氧化碳吸附水分子为例，展示了…

本视频由华算科技-MS杨站长团队制作，本期内容包括：使用Materials Studio VP模块预测肉桂酸酯紫外光谱，涵盖分子结构构建、几何优化、半经验Warp计算及溶剂效应分析…