干货
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EXAFS原理大揭秘!关键知识点全在这!
做测试 找华算 说明:本次主要介绍EXAFS的基本原理,包括EXAFS是如何产生的?EXAFS的基本理论公式是什么?什么是热和静畸变效应和多体效应?想学更多XAFS…
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真会玩!用白酒做溶剂,然后发《Nature》!!
来源丨化学宝库 美国斯克里普斯研究所(TSRI)年轻的有机化学大牛Phil. S.Baran课题组发明了一种让复杂有机分子耦合的新方法,并合成了60多种新的化合物,其中90%为新化…
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CP2K入门教程-1:CP2K的安装
CP2K的安装 1.1 直接使用二进制版本 CP2K的安装有很多种方法。最简单的方法是直接使用预编译版本的二进制可执行文件。 用户可以选择从发行版所带的软件源安装预编译版本的CP2…
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采用intel编译器并行编译执行杂化函数计算CP2K
在采用intel的ifort编译支持hybrid functional计算的CP2K时,尽管编译得到了cp2k.popt的可执行模块,但是在运行时常遇到如下的错误: HFX_MEM…
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CP2K入门教程-3:CP2K的功能
CP2K的功能很多,其输入文件的结构也比Gaussian或者VASP等常见的计算化学软件更加复杂。这里,我直接给出各种CP2K输入文件作为例子,并说明其输入文件中各种参数的设置。 …
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学术漫谈|”计算材料学” 与 “量子化学” 的鸿沟
一个明显的事实是:现在有两种“计算”,而相应的科研人群也大体上分为两大类。一部分人做固体材料的计算,包括表面和催化在内,主要使用密度泛函理论(DFT);而另一部分人做[量子化学…
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入门必备-经典的分子动力学软件LAMMPS简版手册
一、简介;本部分大至介绍了LAMMPS的一些功能和缺陷; 1.什么是LAMMPS?;LAMMPS是一个经典的分子动力学软件;LAMMPS是一可以修改和扩展的计算程序; 2.LAMM…
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Gnuplot科学绘图(四)——多组数据绘图
【作者前言】 对于科技工作者来说,gnuplot 是一个非常好用的绘图软件。因为感慨于gnuplot 中文资料和文档的缺乏,我于数月之前在科学网博客开始撰写“谈谈gnuplot”系…
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前沿进展|机器学习方法预测材料性能的新进展
近二十年来,机器学习方法的发展为我们的生活带来了许多便利。智能网络搜索、语音识别,乃至无人超市、无人驾驶汽车等,依托于机器学习方法的新事物正迅速地在我们的生活中普及。Alpha G…
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LAMMPS命令解读系列–fix nve/limit command使用及注意
这个命令是设置初始状态常用命令,经典命令格式【fix 1 all nve/limit 0.1】,我们一般直接用即可【LJ单位下】,注意此命令只能模拟开始使用,真正需要记录模拟信息时…
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Gnuplot科学绘图(六)——输出pdf 和png 图片
【作者前言】 对于科技工作者来说,gnuplot 是一个非常好用的绘图软件。因为感慨于gnuplot 中文资料和文档的缺乏,我于数月之前在科学网博客开始撰写“谈谈gnuplot”系…
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CP2K入门教程-8:振动频率分析
用CP2K程序进行振动频率分析,首先需要设置RUN_TYPE为VIBRATIONAL_ANALYSIS。输入文件例子如下: &GLOBAL PROJECT cp2k RUN…
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计算案例|在稀土催化材料中的应用关于氧化铈不同缺陷形成熵的第一性原理研究
【研究背景】 众所周知,氧化铈是一种具有萤石结构,带隙约为6 eV的绝缘体。纯氧化铈和异价掺杂氧化铈由于其广泛应用而引起人们关注。它们可应用到涂层材料、研磨材料中,同时也是汽车尾气…
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能带结构图、态密度图的基本分析方法
色散图和DOS图一般也就长这样 不光电影有3D的,态密度也有3D (a)顶视图和(b)侧视图,其中的黄色表示电荷累积,青色相反。 (c)声子谱和态密度。面外的横波光学声子模式(TO…
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这些下一代超算运行时太热,得放进冷库
量子计算时代很快就会到来,世界会出现极大变化。 虽然媒体一直紧盯哪个国家能开发出最先进人工智能系统,但另一项重要的竞赛也在不断升温,就是谁能第一个造出量子计算机。 该领域近年来突飞…
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心得分享|关于结构弛豫设置及收敛判据选择的一点体会
一、收敛判据的选择 结构弛豫的判据一般有两种选择:能量和力。这两者是相关的,理想情况下,能量收敛到基态,力也应该是收敛到平衡态的。但是数值计算过程上的差异导致以二者为判据的收敛速度…
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实验与理论计算相结合:高选择性的金属纳米催化剂的理性设计
苯胺类化合物是制备药物、聚合物、除草剂和其它精细化学品的中间体,其制备方法通常是对带有还原官能团的硝基化合物进行加氢。然而,由于底物分子同时含有两个或多个还原基团,对其高效选择性加…
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MIT人工突触芯片新突破:指甲大小的芯片有望媲美超算
论传递信息的能力,计算机的二进制目前还比不上人脑。因为大脑神经元之间传递的信号形式远多过0或1两种:根据突触(神经元之间的结构)间不同的神经递质,不同的浓度,下游神经元可以拿到不一…
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解决个经常困扰新手的问题,VMD如何显示晶胞格子?
VMD是一款非常强大的分子动力学后处理软件,而在使用中有个问题经常困扰新手,如何在周期性模型上加上晶胞格子使其看起来更“漂亮”一点呢?VMD默认是不画晶格的 但作为一个强大的软件,…
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计算案例丨极性金属间化合物CaZn2和SrZn2结构稳定性和力学性质研究
采用第一性原理研究方法计算了CeCu2型和MgZn2型极性金属间化合物CaZn2和SrZn2的结构稳定性和电子结构。平衡态晶格常数和实验值非常接近。形成焓计算结果表明CeCu2型的…