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MS氢键脚本-Materials Studio分子动力学:片段间氢键Hbond长度、角度、数量的概率分布函数PDF及随时间演化,固液界面,溶液,蛋白质,聚氨酯
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:片段间氢键Hbond长度、角度、数量的概率分布函数PDF及随时间演化,固液界面,溶液,蛋白质,聚氨酯 MS杨站长,曾就职于德国马…
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【Materials Studio脚本】分子质心运动轨迹 用于分子动力学分析 锂离子、锌离子电池、生物计算必备 | MS杨站长 华算科技
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:如何使用Materials Studio脚本绘制分子质心运动轨迹,适用于锂/锌离子电池及生物计算分析。操作简单,选中目标分子原子…
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[Materials Studio] 局域扩散系数MS脚本:细胞膜磷脂双分子层、表面、纳米管等限域结构小分子局域扩散系数 | MS Frocite分子动力学
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:使用Materials Studio脚本计算局域扩散系数的方法。首先,通过固定目标分子并记录其受到的力,研究者可以分析特定区域内…
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MS氢键统计脚本HBonds.pl 氢键键长键角数量统计 PDF | Materials Studio脚本特训营 | 华算科技-MS杨站长
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:MS氢键统计脚本HBonds.pl的使用与扩展。杨站长将官方提供的50行脚本扩展到300多行,增加了功能,使其能够统计氢键的键长…
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MS锂离子在固态、液态电解质中迁移路线、轨迹脚本 [Materials Studio分子动力学] MS杨站长 华算科技
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:使用Materials Studio分子动力学模拟锂离子在固态/液态电解质中的迁移轨迹,通过脚本提取XYZ坐标、Origin优化…
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MS离子迁移、过渡态反应路径作图脚本 [Materials Studio过渡态、分子动力学] 原子扩散轨迹、迁移路径、溶液、固态电解质、正极材料、电解液
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:如何使用Materials Studio脚本绘制离子迁移路径图,通过XYZ_structure脚本提取轨迹数据,结合周期性边界条…
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[Materials Studio] 分享3个分子动力学脚本!MS Forcite: 运动轨迹+局域扩散系数+同类分子选中-锂离子迁移、溶液、表面界面纳米管扩散
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:关于分子动力学的三个脚本分享。首先,介绍了如何使用脚本绘制分子运动轨迹,通过实例展示了钠离子和氯离子在水中的布朗运动。其次,讲解…
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华算科技-MS杨站长 | Materials Studio-在linux服务器上交作业的脚本该怎么写?(3)
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:手动设置作业名称避免空格问题,通过重定向输出到指定文件记录运行信息,并强调根据作业管理系统调整脚本内容,确保高效提交与执行计算任…
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华算科技-MS杨站长 | Materials Studio-MS在linux服务器上交作业的脚本该怎么写?(1)
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:在Linux集群上通过Material Studio提交作业的两种方式:Gateway模式(自动提交并返回数据,但多数超算中心不…
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华算科技-MS杨站长 | Materials Studio-在linux服务器上交作业的脚本该怎么写?(2)
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:export命令设置环境变量如BELVIA_DIR,并将程序路径加入PATH环境变量,确保命令可直接调用。同时需指定临时文件夹路…
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MS径向分布函数RDF Radial Distribution | Materials Studio Forcite分子动力学MD轨迹分析
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:如何使用Materials Studio的Forcite进行分子动力学MD轨迹分析,特别是如何计算镜像分布函数(RDF)。通过定…
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MS配位数脚本Coordination Number (分子动力学MD轨迹分析) | Materials Studio Forcite | 华算科技MS杨站长
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:如何利用Materials Studio Forcite软件通过自定义脚本计算配位数,结合镜像分布函数分析锂-氧原子间的配位关系…
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MS分子动力学加电场脚本 | Materials Studio Forcite | 华算科技 -MS杨站长
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:如何在Materials Studio Forcite中为分子动力学轨迹施加电场,通过修改脚本参数设置001方向电场强度1,并演…
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ChatGPT帮我编程MS脚本 | Materials Studio脚本 | MS杨站长 华算科技
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:ChatGPT编写Materials Studio脚本将差分电荷密度文件转换为VESTA可读格式的过程,指出代码可能存在错误并需…
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Materials Studio高通量计算脚本 | 批量算带隙、DOS、ELF、结构优化、形成能、光学性质、原子电荷价态、差分电荷密度 | MS杨站长 华算科技
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:材料科学领域中高通量计算脚本的应用。杨站长详细介绍了如何使用Materials Studio进行批量计算带隙、DOS、ELF、结…
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电荷差分密度图沿z轴的分布(含脚本)| Materials Studio 华算科技-MS杨站长
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:电荷差分密度图沿z轴分布的原理与绘制方法。通过脚本对不同Z值进行统计,得到电荷差分密度的分布图。以二氧化碳吸附水分子为例,展示了…
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解决二维材料结构优化不收敛或散架问题的利器 — EOS_2D.pl | MS脚本速成班 | 华算科技MS杨站长
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:使用EOS_2D.pl脚本优化二维材料结构,通过调整晶格常数C轴范围、结合晶体状态方程分析能量最低点,精准定位稳定结构,避免全细…
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解决结构优化不收敛或散架问题的利器 — EOS.pl | MS脚本速成班 | 华算科技-MS杨站长
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:使用Material Studio的EOS.pl脚本高效解决结构优化不收敛或散架问题,通过批量计算晶体状态方程生成体积-能量曲线…
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[Materials Studio] 预测肉桂酸酯的紫外光谱 | 理论计算 华算科技
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:使用Materials Studio VP模块预测肉桂酸酯紫外光谱,涵盖分子结构构建、几何优化、半经验Warp计算及溶剂效应分析…
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[Materials Studio] 利用VAMP模块进行几何优化及过渡态搜索 | 理论计算 华算科技
本视频由华算科技-MS杨站长团队制作,本期内容包括:利用Materials Studio VAMP模块进行电缆分子几何优化、过渡态搜索及反应路径分析,涵盖结构优化、电荷振动模态计算…