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《VASP实用教程》第四十九弹：线性钠链运输特性以及(5,0)碳纳米管的传输性能
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概要：比较周期性线型钠原子链与有缺陷链的量子电导。
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目录：examples/example14/periodic
examples/example14/defected
– Na_chain.scf 用于基态计算的PWSCF输入文件
– Na_chain.nscf 用于获取传导态的Bloch态的PWSCF输入文件
– Na_chain.pw2wan pw2wannier90的输入文件
– Na_chain.win wannier90的输入文件
周期性系统包含两个沿超胞均匀分布的单胞。传输计算使用transport_mode = bulk进行，因此产生的量子电导代表了无限周期链的量子电导。
wannier90输入文件中控制传输部分计算的部分如下
translation_centre_frac = 0.5 0.5 0.5
缺陷系统使用13个原子超胞，中心原子位置被改变以打破对称性。设置 transport_mode = lcr，如此设置wannier90会将系统作为一个中心有缺陷的无限系统。超胞的选择要符合 2c2 几何学（详见用户指南）。每个主层的长度为2个原子，因此导体区域包含缺陷原子以及两侧的单个原子。
这些和其他与传输属性的计算有关的关键字的说明可以在《用户指南》中找到。
【1】对周期系统运行PWSCF和wannier90。
【2】对缺陷系统运行PWSCF和wannier90。
【3】量子电导分别写入文件periodic/Na_chain_qc.dat和有缺陷的/Na_chain_dos.dat。将周期（体）计算的量子电导与缺陷（LCR）计算进行比较。得到的结果图应与图1类似。
图1.周期性钠链（黑色）和有缺陷的钠链（红色）的量子电导的对比。
请注意，这些系统需要进行合理的大规模电子结构计算。
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目录：examples/example14/periodic
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– cnt.scf 用于基态计算的PWSCF输入文件
– cnt.nscf 用于获取传导态的Bloch态的PWSCF输入文件
– cnt.pw2wan pw2wannier90的输入文件
首先，我们考虑一个单体原胞，有10个k点。在transport_mode = bulk的情况下，我们计算一个原始的、无限的、周期性的(5,0)碳纳米管的传输特性。稍后，我们将比较该系统与缺陷纳米管的量子电导。
【2】量子电导和态密度分别写入文件cnt_qc.dat和cnt_dos.dat。
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概要：使用自动LCR例程来研究无限（5,0）碳纳米管中单个硅原子的效果。
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目录：examples/example15/defected
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– cnt+si.scf 用于基态计算的PWSCF输入文件
– cnt+si.nscf 用于获取传导态的Bloch态的PWSCF输入文件
– cnt+si.pw2wan pw2wannier90的输入文件
– cnt+si.win wannier90的输入文件
在此计算中，在中心原胞中使用具有单个硅取代缺陷的11原子超胞。选择超胞，使其符合2c2几何形状（有关详细信息，请参见《用户指南》），其主要层设置为两个原胞长。
【1】运行PWSCF和wannier90。同样这些都是大型计算，可以通过查看各自的输出文件来查看进度。
【2】量子电导被写入cnt+si_qc.dat。将量子电导与周期性（体积）计算结果进行比较。得到的结果图应该与图2一致。
图2. 无限原始纳米管的量子电导（黑色）与具有替代硅缺陷的无限纳米管的量子电导（红色）对比
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