计算化学与分子模拟
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DFT算不准能带,那还有什么用呢?从 PBE 泛函的局限性到材料研究中的价值重构
本文阐述了使用GGA-PBE泛函进行DFT带隙计算时常出现比实验值低约40%~50%的系统性偏差,其根本原因在于常规模型缺乏“导数不连续”校正且存在自相互作用误差。 随后指出尽管绝…
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机器学习势函数 VS 分子动力学(MD)模拟
机器学习势函数的定义与基本原理 机器学习势函数(Machine Learning Potentials, MLFFs)是一种基于机器学习技术的势能函数,用于模拟分子和材料的物理行为…
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分子动力学模拟:原理、步骤、软件、方法!
在微观世界中,分子的动态行为如同一场精妙的舞蹈,深刻影响着物质的性质和功能。分子动力学模拟(Molecular Dynamics, MD)作为探索分子尺度奥秘的强大工具,是一种基于…
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为什么热催化要算过渡态,光催化电催化却不用呢?
催化反应路径的建模与决速步(Rate-Determining Step, RDS)识别是理论催化研究的核心内容之一。本文系统梳理了密度泛函理论(DFT)在热催化、电催化与光催化三类…
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DFT计算还是MD模拟?——两种主流计算方法的正确应用方式
本文系统比较了第一性原理计算(以密度泛函理论为代表)与分子动力学模拟在材料研究中的理论基础、应用特征与适用边界。 第一性原理计算以电子结构为核心,擅长于吸附行为、反应路径与过渡态分…
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如何通过RDF分析材料结构?
本文系统介绍了径向分布函数(RDF)的定义、数学表达及其在分子动力学(MD)模拟中的核心作用。 RDF通过量化粒子间距的概率分布,能够揭示材料短程有序性和长程无序性特征,成为解析微…
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分子动力学模拟(Molecular Dynamics, MD)
分子动力学模拟(Molecular Dynamics, MD)是一种通过经典力学方法研究原子和分子随时间演化行为的计算模拟技术。 其基本思想是根据牛顿第二定律,利用原子间相互作用的…
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为什么声子谱很重要?
声子谱的定义 声子谱(Phonon Spectrum)是描述晶体中原子集体振动模式(声子)的频率分布随波矢(q)变化的图示,横轴通常为布里渊区(Brillouin Zone)中的对…
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径向分布函数RDF如何分析?
在电解液分子动力学研究中,径向分布函数(Radial Distribution Function,RDF)是一种用于描述粒子间相对距离分布的统计工具。它能够反映系统中粒子的局部密度…
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从头算分子动力学AIMD与经典分子动力学MD的计算成本与精度分析:时间尺度、系统尺寸与力场依赖性
分子动力学模拟的介绍 分子动力学模拟(Molecular Dynamics Simulation, MD)是一种基于经典力学或量子力学原理的计算方法,通过数值求解粒子系统的运动方程…